前言
作者:木同、毛毛
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人生的前20几年里我都不知道生物信息是什么。我最初听到生物信息这个词是在15年的春天,那时候的我只知道大喊一声德玛西亚。
四年大学时光,一年用来参加社团、学生会和憧憬爱情,然后再看破红尘似的远离他们开始“堕落”;一年用来吃了睡、LOL、逃课不学习考试靠突击、网吧五连坐一直是坑货,就这样都不知道错过了多少美好和缘分;一年用来反省、随波逐流拥入考研大军的怀抱,十分努力的想实现学渣逆袭的梦想;一年用来考研、实习、校招、毕业和离别。
后来才明白这是我的青春岁月,也是很多个人的青春岁月;后来我才明白不用知识武装自己一直在草丛里转圈圈只能让我成为炮灰一样的存在。
我小幸运的从考研大军中爬了出来走向了学渣晋级的道路,然而正是这个小幸运让我阴差阳错、糊里糊涂的入了生信行当。然后通过一系列不知死活的摸爬滚打从最初的计算机白痴(连小白都算不上)到现在学会了Linux、R、perl······;从只有受过高中生物教育水平的菜鸟到如今依然是菜鸟,谁让生命有那么多奥秘呢。
额,废话有点多,下面进入正题——啥是佩奇,哦NO!啥是生物信息?
初识
带我了解生物信息的第一个老师是度娘, 度娘的百科这样说:
生物信息学(Bioinformatics)是研究生物信息的采集、处理、存储、传播,分析和解释等各方面的学科,也是随着生命科学和计算机科学的迅猛发展,生命科学和计算机科学相结合形成的一门新学科。它通过综合利用生物学,计算机科学和信息技术而揭示大量而复杂的生物数据所赋有的生物学奥秘......
大家可自行看一下度娘咋说的,总之说的头头是道看起来很有道理的。在这里说说本人狭义的生物信息的拙见。生物信息说白了就两层意思:一生物,二信息,三工具,这不是废话么。本文首先唠唠生物。
生物指的是地球上的所有生灵,小到细菌、病毒,大到大象、蓝鲸,还有食物链最顶端的人类。人类对万物充满好奇,包括我们自己,于是便开启了一项自人类诞生以来最伟大的研究:生命的奥秘。以人为例,人类千百年来一直在研究一个问题——我是谁?上古,神创造了人,女娲大娘用黄泥巴造了我们的祖先;耶和华用泥造了亚当,用肋吧条儿造了夏娃。总之人是神造的,但是有那么一群人偏偏不信邪,他们信科学,拼了老命打开了近代生命科学的大门。
长图来袭,做好准备:
从达尔文的《物种起源》、进化论,孟德尔的遗传定律到沃森和克里克的DNA双螺旋结构。百年风雨飘摇,先贤们终于拿到了开启生命奥秘的钥匙,向他们致敬。殊不知科学的源头是神学(科学的尽头是啥子?是永无止境,还是周而复始),从唯心主义向唯物主义过度的人必定熟悉唯心主义。毕竟兵法云“知己知彼,百战不殆”。或许你不知道的是达尔文这位牛津大学的高材生最初的专业是神学,“豌豆狂魔”孟德尔先生的另一个职业是神父,资深的天主教徒。
从1859-1970这110年的时间里,人类终于逐渐认识到生命的奥秘,这一个多世纪的积淀与认知便是生物信息学诞生的必要前提。伴随着DNA组成与结构的破解,生命科学迅猛发展,人类发现地球上所有的生灵都诞生在一本“遗传天书”之上,随后破解这本天书的密便成为一代又一代科学工作者终生为之奋斗的目标。
俗话说“工欲善其事,必先利其器”,想砍更多的柴没有斧头是不行的。历史的车轮总是充满巧合,这一时期计算机科学在另一帮大佬的建设下成长为一方巨擘。一切都是那么刚刚好,计算机成为了破解生命奥秘,获取生命中蕴含的大量信息的一大杀器,所向披靡,无往不利。两者在蜜月期中自然而然的就生下了生物信息学这个熊孩子。
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