在金字塔结构的同一主题层级中，可以采用演绎推导或归纳推导的方法来组织思想要点，而这些思想要点之间是通过逻辑关系来连接的。逻辑关系可以保证属于同一组的思想要点没有遗漏，也可以保证没有纳入不合适的思想要点。
在演绎推导的模式中，思想要点之间的逻辑关系就是演绎顺序。那么归纳推导模式呢，这种情况下可以选择某一种或多种逻辑关系。
逻辑关系：
一、时间
按时间顺序连接同一组中的思想要点，这种情况通常是前一步是后一步发生的前提条件，或者在时间上前一步优先于后面步骤。不过有时对于罗列的思想要点无法准确区分原因与结果，这可能会造成逻辑混乱。这要求我们想象执行每一个思想要点时可能产生什么样的结果。
二、结构
按结构顺序连接同一组中的思想要点，要遵循MECE的原则。一是同一组中的思想要点不能重复，相互独立，二是这些思想要点不能遗漏。使用结构顺序检查逻辑结构，可以使用示意图、地图或照片等方式，确保无重复无遗漏。
三、程度
按程度顺序连接同一组中的思想要点，程度也就是重要性，在同一组中的思想要点必然有某一共性，可以根据不同思想要点在共性上的重要程度进行排序。通常是先强后弱，先主要后次要。不过有些情况下也可以把最重要的放在最后面，这主要是为了产生强烈的吸引力，如果是公文或报告则不应该这么做。
如果同一组中的思想要点展现的是逻辑过程（如活动流程），那么应采用时间顺序。如果展现的是地点方位（或组织机构），那么应采用结构顺序。如果展现的是与某一特定群体有关（比如客户或某一特定产品），那么应采用程度顺序（关联性）。如果不能确定选择什么逻辑顺序，那么可以先快速浏览所有的思想要点，然后看看其原因或产生的结果，尝试发现分组的基础。
