香菇工厂化之所以长期不能得到突破，关键原因在于盈利能力低下。上世纪90年代，就有很多人、单位和企业尝试走半工厂化的规模种植，几乎无一不折戟而归。就在人们心中留下了一个根深蒂固的意识，种植香菇就是一家一户的事，谁搞工厂化、规模化谁赔钱。
那时由于在制棒阶段还没有现在的机械，制棒成为劳动最密集、强度最大的环节，推动制棒环节的工厂化、规模化，还没有条件，所以尝试工厂化和规模化的路径，和现在完全相反，都选择从出菇管理入手。人们都把出菇当做最容易实现工厂化管理和上规模的节点，通常做法是，由某个单位、企业和个人出资，政府供地，建立连片香菇大棚，称之为香菇出菇示范基地。菌棒则是从千家万户中购买过来的，由于每家的菌棒都不同，管理的分门别类，结果可想而知，多数赔的要卖裤子了。
现在回想起来，当时工厂化探索恰好是选择了最不该选择的突破点，不成功是自然，不赔钱才怪，其中的原因很复杂，今天不在这里展开叙说。而当前的工厂化和规模化，是从制棒环节进行突破，则是选对了方向，一是具备设施基础，二是在香菇管理上也最好实现工厂化。由于条件具备和选点科学，当前的香菇制棒工厂多数都是能够赚钱的。至于出菇工厂化管理，现在的制约因素还没有完全解决，即便有解决方案，但由于投入产出不成比例，想正常盈利还是比较困难的。未来真正的香菇工厂化，是香菇生产的全程工厂化，是能够实现规模盈利的工厂化，到那时个体盈利将变得困难。
