文献信息
标题:Multiplexed analysis of EV reveals specific biomarker composition with diagnostic impact
日期及杂志:2023 Mar 4, Nat Commun
作者及单位:Joshua D. Spitzberg, Center for Systems Biology, Massachusetts General Hospital, 185 Cambridge St, CPZN 5206, Boston, MA 02114, USA
文献概述(这篇文献的结论是什么?)
该研究提出了一种名为MASEV的迭代多重标记的单个细胞外囊泡(EVs)分析方法,在 15 个 EV 生物标记物的 5 个多通道荧光染色周期中分析数千个单独的 EV。MASEV方法是通过将EV与带有可切割生物正交连接物(C2TCO)的荧光标记抗体结合。在染色过程中,EV被标记的抗体染色,形成荧光信号。然后,通过添加四氮唑(Tz)来切割连接物,将荧光标记从EV上去除。去染色后,EV的荧光信号消失,只剩下永久标记的EV信号。通过多轮的染色和去染色过程,可以获得EV的多个生物标志物的表达模式,从而实现对EV的深入分析。研究结果表明:一些被普遍认为是EV标志物的蛋白在EV中的表达并不如认为的那么普遍;只有一小部分EV单囊泡中同时存在多个标志物;亲和纯化可导致罕见EV亚型的丢失;深度分析单EV蛋白组成,可能提高疾病诊断特异性。
文章亮点(这篇文献的优点在哪?)
主要是实验方面的优点,提出一种新的sEV分析方法MASEV:
是基于传统显微成像技术的改进,与传统方法在EV的大小测定和生物标志物比较方面具有一致性,同时具有更高的效率
采用可切割生物正交连接物C2TCO进行循环染色,可以同时检测和分析多个生物标志物
MASEV创新性采用Tz/TCO切割方法,在多个循环中的可重复性非常好
相对于其他非成像sEV检测技术,MASEV快速、廉价,适用于大规模样本的分析
我的疑问(这篇文献的不足在哪?)
这个方法对于低丰度生物标志物的检测有一定难度,在重复循环时可能会受前一个循环的影响
这个方法使用特定的生物标记物来分析EV,且最多15种蛋白,不然循环染色次数的增加会对分析结果准确性有较大影响
和我相关(我从这篇文献里学到了什么?)
这篇文章主要讲了MASEV方法的原理、实验步骤和验证结果,以及与传统方法的比较
总结:MASEV可以通过以下步骤进行分析:
EV分离:研究中进行了预实验发现eDMC方法效果最好
切割和去染色:通过Tz进行快速去染色,可以通过测量荧光强度的变化来分析EV的生物标志物
EV图像获取:使用超分辨率显微镜对标记的EV进行图像获取
数据分析:对每个周期中EV的荧光强度进行定量测量,可以使用聚类分析和降维分析等方法对数据进行处理,以区分不同细胞来源的EV
数据验证:可以使用其他技术(比如NTA)验证分析的准确性