根鸟十三岁的时候，在森林中遇见一头神秘的白鹰。白鹰给他留下了一张布条，这是一个名叫紫烟的求救信。从此，根鸟不断地梦见开满百合花的大峡谷和那个叫紫烟的女孩。
命运注定一般，根鸟终于踏上了寻找大峡谷的路途。过程中，他遭遇了风吹日晒和人们的冷嘲热讽，甚至是欺骗。他也曾经退缩过，并在逃离矿工追赶后，回到了家乡菊坡，却发现父亲已经奄奄一息。父亲去世后，根鸟曾一度迷失了方向。他很久不再做梦，已经忘记了大峡谷和紫烟。
父亲作为根鸟的灵魂引路人，托梦给他，让他又重新想起大峡谷，想起自己的梦想。于是，根鸟又出发了。为了不给自己留后路，根鸟烧毁了老屋。
这一次上路，根鸟遇见了两个让他感觉温暖的女孩子——秋蔓和金枝。秋蔓如同藤蔓一般，将根鸟束缚住，金枝也使根鸟的寻梦之路横生枝节。但最终，根鸟挣脱了温暖的牢笼，找到了大峡谷。
故事的结尾，没有交待女孩紫烟的情况。只是根鸟躺在百合花中痛哭了一场。大峡谷于他而言，太熟悉了，和梦中一模一样。来到这里，就像故地重游。
他哭，是因为在饱受了那么多痛苦磨难之后，在放弃了一切可能幸福的机会之后，终于实现了梦想。虽然这个梦，终究是一场空，但是他完成了自己内心的壮举，换来了此生无憾。
