Misztal2013 由谱系信息和标记信息得到H矩阵

Misztal I, Aggrey SE, Muir WM. Experiences with a single-step genome evaluation 1. Poult. Sci. 2013;2530–4.

基因组选择可以基于基因组关系矩阵(GBLUP)来实现,并且可以通过使用最佳线性无偏预测(BLUP)与来自非种类型动物的表型组合。组合两个信息源的常见方法涉及多个步骤,但是难以与复杂模型一起使用并且是非最佳的。称为单步GBLUP或ssGBLUP的更简单的方法将基于群体的谱系关系(A)的基因组导出关系(G)整合到组合关系矩阵(H)中,并允许在单一步骤中进行基因组选择。 ssGBLUP方法易于实现并使用标准的基于BLUP的程序。鸡,猪和乳牛场数据的经验表明ssGBLUP更准确,但比多步骤方法简单得多。 ssGBLUP的当前极限是大约100,000个基因型和18个性状。涉及1000万只动物的模型已成功运行。 H的逆也可以在用于参数估计的现有程序中使用,但是对于无偏估计需要适当地缩放的G.此外,由于基因组预测可以转换为SNP效应,ssGBLUP可用于基因组范围的关联研究。基因组选择的单步方法将基因组信息的使用转化为标准BLUP,方差分量估计程序成为一个常规。

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