孟德尔随机化分析

  • 原理


    image.png

    Z与U无关
    Z与X相关
    Z与Y无关
    即,Z只能通过X与Y产生关联

  • SNP获取


    image.png

    image.png
  • 偏倚


    image.png
image.png
  • MR研究设计方式


    image.png

    image.png
  • 统计分析方法


    image.png

    image.png
  • 方法学步骤
    筛选SNP ,p自行设定,一般8*10^-8


    image.png

    去掉在10000kb范围内,与最显著SNP r^2>0.001的SNP


    image.png

    筛选出工具变量与暴露因素不具有强相关性的表型变异or工具变量只能解释小部分的表型变异
    image.png

    协调方向性,有时是相反的
    image.png

    混杂因素的筛选,剔除相关SNP


    在该网站搜索位点,以确定筛选出的SNP是否与混杂因素强相关

    image.png
  • 结果解读:可视化结果展示
    x对y有相关
    image.png

    每条实线代表单个SNP利用**方法估计出来的结果
    image.png

    单看每个SNP的结果可能是不统一,要综合所有SNP的结果来看,也就是最下面的结果。
    一条是MR egger的结果,一条是IVW估计的结果
    image.png
  • 敏感性分析


    去掉一个snp,剩余所有snp对整体误差不大,均在0的右侧,说明结果可靠

    image.png
  • MR分析流程


    image.png
©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
平台声明:文章内容(如有图片或视频亦包括在内)由作者上传并发布,文章内容仅代表作者本人观点,简书系信息发布平台,仅提供信息存储服务。

推荐阅读更多精彩内容