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    R语言可视化13: (sc)RNAseq 数据可视化 - ClusterGVis

    ClusterGVis包是中国药科大学Jun Zhang博士开发的系列可视化工具包之一,前期该包主要设计用于Bluk-seq表达矩阵的处理,可同...

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    R语言可视化12: (sc)RNAseq 数据可视化 - scRNAtoolVis

    scRNAtoolVis适用于各种单细胞RNA-seq数据分析场景,包括但不限于:单细胞Marker基因表达热图:通过热图展示不同细胞亚群中Ma...

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    孟德尔随机化分析2: SMR

    SMR(Summary data-based Mendelian Randomization)是一个针对汇总数据的孟德尔随机化方法,可以基于GW...

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    生信工具2: LiftOver

    人类参考基因组(如 GRCh37 和 GRCh38)由国际基因组学研究社区定期更新,以改进基因组的完整性和准确性。每次更新可能会导致以下变化:ꔷ...

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    孟德尔随机化分析1: 连锁不平衡(Linkage Disequilibrium, LD)

    1. 什么是连锁不平衡(LD)? 连锁不平衡(Linkage Disequilibrium,LD)是指在基因组中,两个或多个SNP(单核苷酸多态...

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    R语言小记3:ENSG和基因symbol间的名称转换

    0. 数据准备(加载自己需要转换的数据) 1. 使用其他R包"AnnotationDbi"和"org.Hs.eg.db" ꔷ 发现存在一个ENS...

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    单细胞数据分析笔记6: 转录因子分析(SCENIC)

    转录因子(transcription factors, TFs)是指能够识别、结合在某基因上游特异核苷酸序列上的蛋白质。其通过介导RNA聚合酶与...

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    单细胞小记2:将h5ad格式转化为seurat格式

    h5ad 是用于存储单细胞 RNA 测序(scRNA-seq)数据的文件格式,常用于 Python 中的 Scanpy 软件包。它基于 HDF5...

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