Title : The Cancer Genome Atlas Data Integration
Version : Version 1.18.0
Description : 癌症基因组图谱(TCGA)数据门户提供平台包括搜索、下载和分析数据集TCGA生成的。它包含临床信息,序列分析基因组特征数据和高水平肿瘤基因组。关键是理解基因组学,提高癌症治疗水平。RTCGA包提供下载和集成TCGA的种类和体积数据的使用病人条码键,使数据更容易获得。这可能有一种benefcial ?影响发展的影响科学和改善病人的治疗。此外,TCGA的RTCGA包转换数据整理形成的方便使用。
BugReports : https://github.com/RTCGA/RTCGA/issues
(1)下载数据
library(magrittr)
infoTCGA() %>%
# select less variables so that tables fits webpage
dplyr::select(Cohort, BCR, Clinical, Methylation, mRNASeq) %>%
head() %>% # without that you can see all cohorts
knitr::kable()