来自Gentore培训（奥胡斯大学，Emre Karaman,2022/6/29）
目的：对杂交动物做GP
目录
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1 基因组估计
前基因组世代：
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传统育种选择取得了成功：
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Meuwissen等提出GS（贝叶斯法）
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预测的准确性
在同一个品种内：
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GP准确性会变化
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QTL model
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SNP model
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SNP与QTL的关系
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连锁不平衡-LD
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Ne在同品种中不同
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所以根据上述的公式，SNP与QTL的关系在各品种中不同
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重组率也不相同
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不同猪群体的LD
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不同猪群体的Marker效应也不同
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QTL的效应应该也不太相同
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2 统计品种不同的算法
使用HD 数据，但是WGS提升效果不明显
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应选出WGS的SNP，提升效果也不大
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不同品种联合分析，需要品种的QTL一样，提升不大
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多性状模型
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结果
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杂交动物数据，最简单考虑品种杂交比例在单性状模型中
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例子
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杂家品种数据处理
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小结
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