SANGER测序

1. 双脱氧核苷酸(ddNTP)

缺少3'位的羟基的ddNTP结合到DNA链上,会使得后面的单脱氧核苷酸(dNTP)无法再聚合上来,致使聚合反应终止。





二、测序介绍

第一步:加入bigdye试剂(包含四种带荧光标记的ddNTP、四种dNTP、DNA聚合酶、镁离子、ph缓冲液等。)进行聚合反应。

在进行聚合反应时,有可能结合上ddNTP且终止反应,也有可能结合上正常dNTP正常反应,直到结合上ddNTP终止反应。反应结束生成长短不一的含有荧光标记的DNA片段混合物(荧光颜色(代表的碱基)与模板的碱基有互补对应的关系)。


第二步: 过滤混合物,去除ddNTP等其他杂质,只留下长短不一的DNA片段。

第三步:上机测序

1)先在长长的中空的玻璃毛细管中注入丙烯酰胺溶液,用紫外光照射丙烯酰胺溶液发生聚合反应变成聚丙烯酰胺凝胶。

聚丙烯酰胺凝胶对于在其中电泳的核酸有分离作用,短的片段在其中电泳得快,长的片段在其中电泳的慢。

2)把DNA片段混合物,加到有聚丙烯酰胺凝胶的毛细管的一段,在毛细管的两端加上高电压,DNA片段就在电场的作用下,从负极向正极电泳。

3)在毛细管正极的末端,用激光进行照射,并用分光的光学传感器把不同颜色的荧光强度记录下来。每个DNA片段在经过激光点扫描时,它上面带有的荧光基团就会发出特定颜色的荧光。



出处:

作者:看远方的星

链接:https://www.jianshu.com/p/71264815fd6a

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