安装过程中--中文路径--的问题还是值得记录一下！跳坑指南：用搜狗微信搜索---“生信星球 当Rstudio杠上中文用户名”.
认识R和Rstudio
R是一门用于统计计算和作图的语言，受S语言影响发展而来。它汇集了许多函数，能够提供强大的功能。R语言软件界面简陋，追求视觉体验，用户通常选择使用图形界面的Rstudio来替代R软件。
RStudio是免费提供的开源集成开发环境（IDE）。RStudio提供了一个具有很多功能的环境，使R更容易使用，是在终端中使用R的绝佳选择。
Rstudio界面
如下图所示，界面可以分为四个部分：
设置Rstudio字体大小
R语言基本操作
用Rproject管理工作目录
当你有多个项目并行的话，应该避免全都在一个文件夹下，所以选择设置对应多个项目的多个工作目录。干货指南----用搜狗微信搜索：“生信星球 R-project管理多个R工作目录”.
显示文件列表
dir()；list.files()：显示默认路径，也就是工作目录（直接打命令不跟路径），相当于linux的ls。
加减乘除
赋值
赋值符号用小于号加上减号打出 <-，或者快捷键Alt加减号。例如，x<- 1+2 即把1+2的运算结果赋值给x， 按enter键赋值后，x会在右上角Globe Environment的Value列表显示。在控制台再输入x， 回车，即返回x的值。
删除变量
rm(b) #删除变量b
rm(u,c) #删除变量u和变量c
rm(list = ls()) #清空所有变量
列出历史命令
history() ----相当于鼠标单击右上角的history标签，运行之后，我们可以在右上角的History界面中看到刚刚使用过的命令。或者我们可以直接右键点击History来查看历史命令。
另外，在History命令中双击某个命令，这个命令便会出现在左下角的控制台，方便我们再次使用同样的命令。
清空控制台
ctrl+l 快捷键
作者：夏目14
链接：https://www.jianshu.com/p/5092416bc79e
来源：简书
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下面的内容是R for data science里ggplot绘图基础内容
涉及到的R包有：ggplot2
数据：R内置的mpg
mpg
# A tibble: 234 x 11
manufacturer model displ year cyl trans drv cty hwy fl class
<chr> <chr> <dbl> <int> <int> <chr> <chr> <int> <int> <chr> <chr>
1 audi a4 1.8 1999 4 auto(l5) f 18 29 p compact
2 audi a4 1.8 1999 4 manual(m5) f 21 29 p compact
3 audi a4 2 2008 4 manual(m6) f 20 31 p compact
4 audi a4 2 2008 4 auto(av) f 21 30 p compact
5 audi a4 2.8 1999 6 auto(l5) f 16 26 p compact
6 audi a4 2.8 1999 6 manual(m5) f 18 26 p compact
7 audi a4 3.1 2008 6 auto(av) f 18 27 p compact
8 audi a4 quattro 1.8 1999 4 manual(m5) 4 18 26 p compact
9 audi a4 quattro 1.8 1999 4 auto(l5) 4 16 25 p compact
10 audi a4 quattro 2 2008 4 manual(m6) 4 20 28 p compact
# ... with 224 more rows
ggplot绘图基本结构
ggplot(data = <DATA>) +
<GEOM_FUNCTION>(mapping = aes(<MAPPINGS>))
在图形上添加变量
重要的概念：图形属性映射，就是将你要在图片上体现的变量，用不同的图形属性表现出来，比如，你已经用xy轴来定义所有汽车的引擎大小和燃油效率，是用散点图的形式展现，图片上所有的点代表所有的汽车，但是你想让汽车种类在图上也有所体现，这时候就想用图片的颜色来区分不同的汽车种类，或者用形状、大小来区分也可以。简而言之：将变量信息通过图形的可视化属性展现出来。
ggplot(data = mpg) +
geom_point(mapping = aes(x = displ, y = hwy, color = class))
aes是将变量信息和图形属性相连接，如果要改变整个图形的外观，需要放在aes括号外。
ggplot(data = mpg) +
geom_point(mapping = aes(x = displ, y = hwy), color = "blue")
另一种添加变量的方式是分面
ggplot(data = mpg) +
geom_point(mapping = aes(x = displ, y = hwy)) +
facet_wrap(~ year, nrow = 2)
ggplot(data = mpg) +
geom_point(mapping = aes(x = displ, y = hwy)) +
facet_grid(drv ~ cyl) ##drv放在y轴，cyl放在x轴，下图
ggplot(data = mpg) +
geom_point(mapping = aes(x = displ, y = hwy)) +
facet_grid(. ~cyl) ###cyl在x轴
ggplot(data = mpg) +
geom_point(mapping = aes(x = displ, y = hwy)) +
facet_grid(drv~ .) ##drv在轴
几何对象
指我们表示数据的几何对象类型，如条形图使用条形几何图像
ggplot(data=mpg)+
geom_smooth(mapping = aes(x=displ,y=hwy,linetype=drv)
如果想要得到这个图形：
刚开始自己写的
ggplot(data=mpg)+
geom_smooth(mapping = aes(x=displ,y=hwy,linetype=drv,color=drv))+
geom_point(mapping = aes(x=displ,y=hwy,color=drv))
或者
ggplot(data=mpg,mapping=aes(x=displ,y=hwy,color=drv))+
geom_point()+
geom_smooth(mapping = aes(linetype=drv))
作者：周ZHX
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来源：简书
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