安装过程中--中文路径--的问题还是值得记录一下！跳坑指南：用搜狗微信搜索---“生信星球 当Rstudio杠上中文用户名”.

认识R和Rstudio

R是一门用于统计计算和作图的语言，受S语言影响发展而来。它汇集了许多函数，能够提供强大的功能。R语言软件界面简陋，追求视觉体验，用户通常选择使用图形界面的Rstudio来替代R软件。

RStudio是免费提供的开源集成开发环境（IDE）。RStudio提供了一个具有很多功能的环境，使R更容易使用，是在终端中使用R的绝佳选择。

Rstudio界面

如下图所示，界面可以分为四个部分：

image

设置Rstudio字体大小

image

R语言基本操作

用Rproject管理工作目录

当你有多个项目并行的话，应该避免全都在一个文件夹下，所以选择设置对应多个项目的多个工作目录。干货指南----用搜狗微信搜索：“生信星球 R-project管理多个R工作目录”.

显示文件列表

dir()；list.files()：显示默认路径，也就是工作目录（直接打命令不跟路径），相当于linux的ls。

加减乘除

image

赋值

赋值符号用小于号加上减号打出 <-，或者快捷键Alt加减号。例如，x<- 1+2 即把1+2的运算结果赋值给x， 按enter键赋值后，x会在右上角Globe Environment的Value列表显示。在控制台再输入x， 回车，即返回x的值。

删除变量

rm(b) #删除变量b
rm(u,c) #删除变量u和变量c
rm(list = ls()) #清空所有变量

列出历史命令

history() ----相当于鼠标单击右上角的history标签，运行之后，我们可以在右上角的History界面中看到刚刚使用过的命令。或者我们可以直接右键点击History来查看历史命令。
另外，在History命令中双击某个命令，这个命令便会出现在左下角的控制台，方便我们再次使用同样的命令。

清空控制台

ctrl+l 快捷键

作者：夏目14
链接：https://www.jianshu.com/p/5092416bc79e
来源：简书
著作权归作者所有。商业转载请联系作者获得授权，非商业转载请注明出处。

下面的内容是R for data science里ggplot绘图基础内容
涉及到的R包有：ggplot2
数据：R内置的mpg

mpg
# A tibble: 234 x 11
   manufacturer model      displ  year   cyl trans      drv     cty   hwy fl    class  
   <chr>        <chr>      <dbl> <int> <int> <chr>      <chr> <int> <int> <chr> <chr>  
 1 audi         a4           1.8  1999     4 auto(l5)   f        18    29 p     compact
 2 audi         a4           1.8  1999     4 manual(m5) f        21    29 p     compact
 3 audi         a4           2    2008     4 manual(m6) f        20    31 p     compact
 4 audi         a4           2    2008     4 auto(av)   f        21    30 p     compact
 5 audi         a4           2.8  1999     6 auto(l5)   f        16    26 p     compact
 6 audi         a4           2.8  1999     6 manual(m5) f        18    26 p     compact
 7 audi         a4           3.1  2008     6 auto(av)   f        18    27 p     compact
 8 audi         a4 quattro   1.8  1999     4 manual(m5) 4        18    26 p     compact
 9 audi         a4 quattro   1.8  1999     4 auto(l5)   4        16    25 p     compact
10 audi         a4 quattro   2    2008     4 manual(m6) 4        20    28 p     compact
# ... with 224 more rows

ggplot绘图基本结构

ggplot(data = <DATA>) +
<GEOM_FUNCTION>(mapping = aes(<MAPPINGS>))

在图形上添加变量

重要的概念：图形属性映射，就是将你要在图片上体现的变量，用不同的图形属性表现出来，比如，你已经用xy轴来定义所有汽车的引擎大小和燃油效率，是用散点图的形式展现，图片上所有的点代表所有的汽车，但是你想让汽车种类在图上也有所体现，这时候就想用图片的颜色来区分不同的汽车种类，或者用形状、大小来区分也可以。简而言之：将变量信息通过图形的可视化属性展现出来。

ggplot(data = mpg) +
geom_point(mapping = aes(x = displ, y = hwy, color = class))

aes是将变量信息和图形属性相连接，如果要改变整个图形的外观，需要放在aes括号外。

ggplot(data = mpg) +
geom_point(mapping = aes(x = displ, y = hwy), color = "blue")

另一种添加变量的方式是分面

ggplot(data = mpg) +
  geom_point(mapping = aes(x = displ, y = hwy)) +
  facet_wrap(~ year, nrow = 2)  
ggplot(data = mpg) +
  geom_point(mapping = aes(x = displ, y = hwy)) +
  facet_grid(drv ~ cyl)   ##drv放在y轴，cyl放在x轴，下图
ggplot(data = mpg) +
  geom_point(mapping = aes(x = displ, y = hwy)) +
  facet_grid(. ~cyl)  ###cyl在x轴
ggplot(data = mpg) +
  geom_point(mapping = aes(x = displ, y = hwy)) +
  facet_grid(drv~ .) ##drv在轴

image

几何对象

指我们表示数据的几何对象类型，如条形图使用条形几何图像

ggplot(data=mpg)+
  geom_smooth(mapping = aes(x=displ,y=hwy,linetype=drv)

image

如果想要得到这个图形：

image

刚开始自己写的

ggplot(data=mpg)+
  geom_smooth(mapping = aes(x=displ,y=hwy,linetype=drv,color=drv))+
  geom_point(mapping = aes(x=displ,y=hwy,color=drv))

或者

ggplot(data=mpg,mapping=aes(x=displ,y=hwy,color=drv))+
  geom_point()+
  geom_smooth(mapping = aes(linetype=drv))

作者：周ZHX
链接：https://www.jianshu.com/p/b81e34559c43
来源：简书
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