初次接触生物信息还是在09年。那时候就觉得这是个很复杂很的技能。不过还是不了解具体的研究内容。认为做DNA,RNA,蛋白序列的比对就是生物信息的功能,真的是太孤陋寡闻了。
12年开始研究生生涯,最初也没有接触过NGS的东西,知道这个很高深,高深在哪里也不知道。知道14年初,自己的课题涉及到RNA-seq才开始了解这个技术的真正的目的。从测序原理,到测序建库,测序能得到的数据开始慢慢学习。
15年开始,从事单细胞RNA-seq的实验,实验室没有人做过这个方向,自己慢慢研究不同单细胞方法之间的优劣,不同方法的成本,实验操作难度等等。一开始也只是和公司合作,将单细胞文库构建好给公司,当时测序加数据的初步分析(到FPKM)公司收费要1000+,面对大量的样品,发现分析成了最大的成本消耗。所以分析成了心病。每一个分析,其实有些真的很简单,但是自己不会操作,只能依附于公司的进度,这个真的很头疼。而且公司不知道你想要的结果,会无形之中错过很多有用的信息。
在湿实验的学习中,因为操作单细胞测序。针对微量样品的实验操作得心应手。慢慢的自己去研究不同测序的建库方式,以最小的成本对单细胞和微量细胞进行了RNA-seq,ATAC-seq,RRBS,WGBS,HiC的建库。令人尴尬的事出现了,数据全部躺在了硬盘里。面对这一现状,需要改变。
目前已经在生殖中心上班,留给自己的时间真的很少,再不学习真的就跟不上了。咬咬牙,配了一个小的服务器,跟着大伙儿一起前进。希望这条路上可以走的远些。