在日常分析中，常碰到需要将序列进行截取，仅保留所关心的位置区间的情况，下面推荐一个小工具，帮你轻松完成这一操作。eGPS的alignment trimmer
可在eGPS官网（http://www.egps-software.net/）或官方QQ群下载软件（550899355）。
1. 选择iTools下的Alignment trimmer
2. 点击Data import里的load，导入一个比对好的fasta文件，需要比对好。
（如果没有比对，也可使用iTools下的Multiple sequence Aligner先进行序列比对）
3. 点击Parameters里的initialize,，然后在下拉框里选择你需要的参考序列，截取位置将以该参考序列的为标注。然后输入你需要截取的起止位置，
4.然后点击Run&Sava data ,软件会将截取后的fasta文件保存在输入文件所在的文件夹中，以.trimmed.fas后缀结尾。
同时也可以点击Run&Go to alignment view 进行截取后序列的可视化
这时点击左上角的保存按钮，一样可以保存截取后的序列文件。
