黄巢起义打破了藩镇之间的平衡制约关系，个别藩镇迅速崛起，其余藩镇则被兼并。而唐昭宗正是在这样的环境下做了大唐最后一位曾有过实权的皇帝，他的儿子唐哀帝虽然是真正的大唐末帝，但实际上并不曾有丁点的皇权。藩镇割据势力在壮大自己的同时，开始干预朝政，想方设法挟天子以令诸侯，唐昭宗成了他们争抢的对象，天子威严荡然无存。
唐昭宗继位之初也曾雄心勃勃，想要于一堆烂泥中力挽狂澜，只是力有不逮，虽然在一定程度上压制了宦官专政现象，但在接下来的解决藩镇问题的时候出现了问题。我们知道，藩镇问题开始于安史之乱后，最初的藩镇割据比较少，最耀眼的就是河朔三镇，河朔三镇起来之后，朝廷开始在帝国各地设置大量的藩镇，形成了平衡制约的关系，这种平衡虽然对皇权形成一定的制约，但是却也在一定程度上延长了大唐的国祚。
但黄巢起义将这种平衡打破，河朔三镇衰落，而个别藩镇强势崛起，唐昭宗招募禁军，开始打压藩镇，但是在接连两次对藩镇的作战中，唐昭宗都败下阵来。第一次是对西川节度使陈敬暄的作战。陈敬暄是田令孜的弟弟，当初，田令孜和唐僖宗闹翻后就投奔了四川，西川开始割据，而田令孜的养子王建和陈敬暄争权，数次相攻伐。后来王建上书唐昭宗另外委派西川节度使，并表示自己会为唐昭宗效力。于是唐昭宗委派韦昭度为西川节度使，王建为永平军节度使。
伐西川之战完全是唐昭宗为他人作嫁衣裳，因为王建在打下四川的大部分地盘之后拒绝回京，并且切断了和唐王朝的联系，并在后来建立了前蜀政权。
唐昭宗伐西川的同时，还在朱温、李匡威、赫连铎等人的要求下攻打李克用，唐昭宗任命张浚为行营都招讨，联合朱温、李匡威和赫连铎攻打河东，但是这一仗同样失败了。李克用上表言辞傲慢的指责唐昭宗，而唐昭宗却只能低头认错。
这两次针对藩镇的战役，不仅没有取得胜利，使禁军损失了大部分的兵力，而且大大降低了天子的威仪，节度使们也见识到了唐昭宗的实力，于是更加不再把唐昭宗放在眼中，反而开始纷纷为自己谋划，甚至试图干涉朝政。尤其是离长安最近的凤翔节度使李茂贞，试图干涉朝政，遭到朝臣的反对后，上书羞辱唐昭宗，唐昭宗命宰相杜让能出兵攻打李茂贞，结果李茂贞攻进了长安，唐昭宗不得不外放杜让能并将其赐死来讨好李茂贞。这一下子天子的威严更是荡然无存。
两年后，李茂贞再次干涉朝政，并兵临长安，唐昭宗吓得想跑到河东去寻找李克用的庇护，只是很不幸的，在半路上被李茂贞的盟友韩建软禁到了华州，并在那里一待就是三年。三年的时间里，天下大势再次反正改变，朱温攻占了洛阳，成为大部分藩镇的威胁，李克用、李茂贞和韩建被迫团结起来，将唐昭宗放回了长安。
回到长安的唐昭宗也并没有什么好日子过，不久，宦官发动政变，囚禁了唐昭宗，逼其退位为太上皇，宰相崔胤和前左仆射张浚求助于朱温，让朱温得以勤王成功，帮助唐昭宗复位。宰相们想借朱温的手除掉干政的宦官，而宦官们和李茂贞勾结，让李茂贞派兵保护长安，在朱温派兵攻打宦官的时候，宦官将唐昭宗挟持到了凤翔，被李茂贞软禁起来。朱温围攻凤翔一年之久终于逼着李茂贞放了唐昭宗。
自此，唐昭宗彻底落在了朱温手中，朱温下令诛杀宦官，将唐昭宗身边全部换成自己的人，并在第二年逼着唐昭宗迁都洛阳，唐昭宗彻底成了一个傀儡皇帝，并很快被朱温除掉，三年后，朱温灭掉了大唐，建立了后梁。
