R 生存分析

生存分析的术语有:生存时间和事件。其中,事件又包括复发性事件、计数事件、死亡等感兴趣的事件。

从开始到发生感兴趣事件的时间,称为生存时间。例如,在癌症研究中,两个重要的结局指标包括:死亡时间(OS, Overall Survival)和无复发存活时间(RFS, Risk Free Survival),其对应于治疗反应与疾病复发之间的时间。它也被称为无病生存时间和无事件生存时间。然而,在研究时间段内,有些人可能不会观察到事件,从而产生所谓的“删失数据”。删失数据的来源包括:1)在研究时间内患者还没有经历过感兴趣的事件,如复发或死亡;2)在研究期间患者失访;3)患者经历不同的事件,使得进一步的随访变得不可能。

K-M曲线用于描述生存概率与生存时间的关系曲线,它提供了一个有用的数据总结,可以用来估计诸如中位生存时间之类的衡量指标。具体R操作:

install.packages(c("survival","survminer"))

library(survival)

library(survminer)

data("lung")

fit<-survfit(Surv(time,status)~1, conf.type='none', data=lung) 

print(fit) #可查看中位数生存时间

更多详细信息可参考:https://www.jianshu.com/p/df3a2d3fb312

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