肥水的方式包含多个操作方式，一是复合肥肥水，二是粪肥发酵肥水，三是微生态方式肥水方式；前两者形不成闭环，肥水后的水质和藻相不稳定，容易倒藻或者转藻，所以不推荐采用前两者进行肥水；而后者可以形成闭环管理，形成良好并且稳定的藻相，水质状态稳定，菌促藻，藻促水，两者相互协同，相互抑制，不容易倒藻或转藻，即使是气温突变或者天气突变（比如强降雨等现象），所以，在常规水体养殖方面上应用的模式采用后者（微生态方式肥水方式）比例较高。
一、忌雨天施肥
雨天水体中浮游植物光合作用不强，对氮、磷等元素的吸收能力较差；雨天水量较大，施肥的有效浓度会降低；溢洪时，肥料流失性大。
二、忌闷热天施肥
天气闷热时水中溶氧低，施肥后水中有机物耗氧量增加，极易造成鱼类因缺氧而浮头、泛塘。
三、忌高温季节施肥
鱼塘施肥宜在每年4～10月、水温20℃～30℃的晴天中午进行，如水温超过30℃，应停施、少施肥料。
四、忌浑水施肥
水体过分混浊，说明水体中黏土颗粒过多，肥料的部分离子易被黏土颗粒吸附固定、沉淀，使肥效迟迟不能释放。
五、忌鱼摄食不旺或暴发疫病时施肥
在鱼摄食不旺时施肥，由肥料培育的大量浮游生物不能被鱼及时利用，易破坏水质；暴发疫病时鱼体抵抗力减弱，若铵态氮肥施用较多易使鱼中毒。
六、忌固态肥干施
干施的氮、磷肥呈颗粒状，在水面停留时间较短，易沉入水底，影响肥效。一般在施用固态氮、磷肥时应将其溶解后对水泼洒全池。
七、忌化肥单施
施肥的主要目的是培育鱼类易消化的浮游生物，而浮游生物一般要求氮、磷、钾的比例为4∶4∶2，如果单施某种化肥，就会制约肥效的充分发挥。
八、忌盲目混施
不是任何两种或多种肥料都可以混合使用的，如施用生石灰，最好等7～10天后再施过磷酸钙，以免两者发生化学反应，使肥效丧失。
九、忌一次施肥过多
一次过量施用铵态氮肥，会使水体中氨积累过多，造成鱼中毒；一次过量施用有机肥，则会使水体中有机物耗氧量增大，造成鱼类缺氧泛塘，所以施肥时切忌一次施肥过多，一般要求4～6天施肥一次。
十、忌施肥后放走表层水
肥料施入水体后一般经过一系列的理化反应，3天后才能被浮游生物充分利用，浮游生物的种群一般均匀分布在水体表面的1-5厘米深处，如果施肥后放走表层水，会降低肥效。
十一、要注意施肥的数量
施肥一般按水面计算，每亩施尿素1千克-1.5千克。磷肥2千克-2.5千克，因为晴天上午施肥时浮游植物多在水体表层，此时利用率高，切忌搅动水面，以防肥料被底泥吸附影响肥效。
十二、施肥要严格按顺序进行
先磷后氮，不要同时施用，以防形成无肥效反而有毒的偏磷酸。
十三、施肥要因鱼而宜
以花白鲢为主或放养较多的应该多施肥，以草鲤鱼等吃料鱼为主的要少施或多施些磷肥，因为大量投喂的饲料会使池水富含大量氮源而缺少磷。
