题外:R 参数通常放在()
括号内,linux放在- letter
空格后
*题外:R 逻辑 & | ,linux && ||
1. 数据描述,查看离群值
查找指定值总记录数
tail(subset(Ukb_v1,Ukb_v1$P==1))
nrow(subset(Ukb_v1,Ukb_v1$P<=5e-8))
查看最小值最大值
head(Ukb_v1[order(-Ukb_v1$P),])
head(Ukb_v1[order(-Ukb_v1$P),])
2.简单的数据查找、合并、排序等
grep查找
PCOS[grep("^7:136207", Out$MarkerName, fixed=FALSE),]
查找替换
ukb
chr=="X"] <- "23"
order排序
merge13 <- merge13[order(-merge13$No),]
paste黏贴字符
Exp1$GRCH37 <- paste(chr, pos, sep=":")
拆分,再提取为新变量
y <- strsplit(ukb
chr <- sapply(y,"[",1)
merge提取数据子集
merge13 <- merge(SDexp,Out, all.x=TRUE, by ="MarkerName")