GEO数据集基因名转换LncRNA

GSE99416 GSE51308 GSE50710 GSE33335 GSE50710

GPL16956 GPL15314 GPL13825 GPL5175 GPL13825

做了三天，终于把这三个GEO数据集探针名对应基因名symbol。

尝试各类方法：

1.基因树的方法，洋洋洒洒几千字，但是下载R包，就无法正常安装。

2.NCBI及ENSEMBLE文件比对，无疾而终，不是代码有错误，就是需要特殊PERL文件。

3.FASTa序列入手，比对基因序列，成功将探针转化为Symbol！此处应该有掌声。

有部分数据集依然无法转换，不过大家可以探讨，联系309739995

最后编辑于：2022.01.14 15:12:57

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