Autodock分子对接完后会生成一个dlg格式的文件
1.查看对接结果
1.1 打开dlg文件
Analyze->Docking->Open->选择.dlg文件->确定
1.2 加上受体大分子
Analyze->Macromolecule->Open
1.3 查看对接能量的合理性
Analyze-clusterings -show
横坐标为Binding energy(结合能)，纵坐标为conformations(构象)
Fig1.PNG
点击可以查看对接的结果。
1.4 查看对接结果详细信息
Analyze->Conformations->Play，ranked by energy
在弹出来的选项框中，选择opens panel to change play options，在show info打勾✔
出现 Conformation x Info
binding energy range in this cluster of x 结合能排序
binding_erergy结合能
ligand_effciency配体效率
inhib_constant抑制常数
inhib_constant_units抑制常数单位
intermal_energy内能
vdw_hb_desolv_energy
electrostatic_energy 静电能
total_intermal
torsional_energy扭转能量
unbound_energy释放的能量
hydrogen bonds forme形成的d氢键
2. 保存
选择某一构想，点击Write Complex
