关于SDTM编程的一些想法(4) -- SE

这篇文章介绍SE的编程思路。

受试者元素数据集(SE)综合了每一受试者在试验过程中的时段(EPOCH)元素(ELEMENT)信息。临床试验的时段(EPOCH)是根据具体的试验设计进行划分,例如,简单的随机对照试验,时段(EPOCH)一般分为3部分,Screening、Treatment、Follow-up。每个时段(EPOCH)中都有不同的元素(ELEMENT)活动,具体可能是筛选、某项治疗、随访、洗脱等。元素(ELEMENT)之间没有间隔,一个元素的结束意味着另一个元素的开始

临床试验中所有的元素信息都会保存在试验元素(TE)数据集中,在TE数据集中,一个元素只会出现一次。临床试验中受试者的分组是由有序排列的元素序列构成,元素代表了临床试验中具有特定目的的一个时间段。受试者分配到某一分组,意味着将会经历特定的系列元素活动。试验分组(TA)数据集保存了试验中每个分组具体的元素和时段信息。

在我理解中,SE的编程本质是对受试者所经历的各时段(EPOCH)中的各元素(ELEMENT)的划分,具体讲,就是找出各个元素之间的“分割点”,即各元素的开始时间和结束时间。

以简单的随机对照试验为例,SCREENING时段中的SCREENING元素的开始点为知情同意书的签订(ICDT),结束点为首次给药。首次给药时间,通常是按受试者和给药时间排序,选出最早的那一条记录时间。

TREATMENT时段中的元素开始点为首次给药,结束点为末次给药(END OF INVESTIGATIONAL PRODUCT)。TREATMENT时段跟另外两个时段有一点不同,其他两个时段的ELEMENT与EPOCH是相同的,而TREATMENT时段中的元素是根据具体的给药分组进行判断,这一点在编程时需要注意。

FOLLOW-UP时段中的FOLLOW-UP元素开始点为末次给药(END OF INVESTIGATIONAL PRODUCT),结束点为研究结束(END OF STUDY)。每个“分割点”的具体发生时间,需要从对应的原始数据集中获取。

在整体的编程思路上,我建议先将每一个元素对应的开始时间或结束时间整理到单独的数据集中,然后将这些数据集按受试者进行拼接,接着对每一条受试者记录进行处理,生成对应时期、元素的记录。例如,以下举例:

data se;
  merge scrstdate  trtstdate fustdate fueddate;
  by usubjid;
  
  length etcd $8. epoch seupdes $40.;
  
  domamin = "SE";
  seupdes = "":

  if scrstdate ne ""  then do;
    etcd = "SCR";
    sestdtc = scstdate;
    seendtc = trtstdata;
    epoch = "SCREENING";
    output;
  end;

  ...
  ...

run;

以上。

若有疑问,欢迎评论区讨论!

最后编辑于
©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
  • 序言:七十年代末,一起剥皮案震惊了整个滨河市,随后出现的几起案子,更是在滨河造成了极大的恐慌,老刑警刘岩,带你破解...
    沈念sama阅读 214,100评论 6 493
  • 序言:滨河连续发生了三起死亡事件,死亡现场离奇诡异,居然都是意外死亡,警方通过查阅死者的电脑和手机,发现死者居然都...
    沈念sama阅读 91,308评论 3 388
  • 文/潘晓璐 我一进店门,熙熙楼的掌柜王于贵愁眉苦脸地迎上来,“玉大人,你说我怎么就摊上这事。” “怎么了?”我有些...
    开封第一讲书人阅读 159,718评论 0 349
  • 文/不坏的土叔 我叫张陵,是天一观的道长。 经常有香客问我,道长,这世上最难降的妖魔是什么? 我笑而不...
    开封第一讲书人阅读 57,275评论 1 287
  • 正文 为了忘掉前任,我火速办了婚礼,结果婚礼上,老公的妹妹穿的比我还像新娘。我一直安慰自己,他们只是感情好,可当我...
    茶点故事阅读 66,376评论 6 386
  • 文/花漫 我一把揭开白布。 她就那样静静地躺着,像睡着了一般。 火红的嫁衣衬着肌肤如雪。 梳的纹丝不乱的头发上,一...
    开封第一讲书人阅读 50,454评论 1 292
  • 那天,我揣着相机与录音,去河边找鬼。 笑死,一个胖子当着我的面吹牛,可吹牛的内容都是我干的。 我是一名探鬼主播,决...
    沈念sama阅读 39,464评论 3 412
  • 文/苍兰香墨 我猛地睁开眼,长吁一口气:“原来是场噩梦啊……” “哼!你这毒妇竟也来了?” 一声冷哼从身侧响起,我...
    开封第一讲书人阅读 38,248评论 0 269
  • 序言:老挝万荣一对情侣失踪,失踪者是张志新(化名)和其女友刘颖,没想到半个月后,有当地人在树林里发现了一具尸体,经...
    沈念sama阅读 44,686评论 1 306
  • 正文 独居荒郊野岭守林人离奇死亡,尸身上长有42处带血的脓包…… 初始之章·张勋 以下内容为张勋视角 年9月15日...
    茶点故事阅读 36,974评论 2 328
  • 正文 我和宋清朗相恋三年,在试婚纱的时候发现自己被绿了。 大学时的朋友给我发了我未婚夫和他白月光在一起吃饭的照片。...
    茶点故事阅读 39,150评论 1 342
  • 序言:一个原本活蹦乱跳的男人离奇死亡,死状恐怖,灵堂内的尸体忽然破棺而出,到底是诈尸还是另有隐情,我是刑警宁泽,带...
    沈念sama阅读 34,817评论 4 337
  • 正文 年R本政府宣布,位于F岛的核电站,受9级特大地震影响,放射性物质发生泄漏。R本人自食恶果不足惜,却给世界环境...
    茶点故事阅读 40,484评论 3 322
  • 文/蒙蒙 一、第九天 我趴在偏房一处隐蔽的房顶上张望。 院中可真热闹,春花似锦、人声如沸。这庄子的主人今日做“春日...
    开封第一讲书人阅读 31,140评论 0 21
  • 文/苍兰香墨 我抬头看了看天上的太阳。三九已至,却和暖如春,着一层夹袄步出监牢的瞬间,已是汗流浃背。 一阵脚步声响...
    开封第一讲书人阅读 32,374评论 1 267
  • 我被黑心中介骗来泰国打工, 没想到刚下飞机就差点儿被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留,地道东北人。 一个月前我还...
    沈念sama阅读 47,012评论 2 365
  • 正文 我出身青楼,却偏偏与公主长得像,于是被迫代替她去往敌国和亲。 传闻我的和亲对象是个残疾皇子,可洞房花烛夜当晚...
    茶点故事阅读 44,041评论 2 351

推荐阅读更多精彩内容