conda的常用命令

conda小环境的构建：

问题：小环境构建了之后会一直保存吗，再一次如何进入？
conda info --envs # 查看环境
conda create -n myenv # 创建一个环境
source activate myenv # 激活进入 myenv环境
conda deactivate # 退出当前环境
conda env remove --name myenv # 移除环境

安装软件

• 从conda网页内查找：http://bioconda.github.io/conda-recipe_index.html
• conda search PACKAGENAME：运行命令查找是否存在
• conda 安装R语言以及R包示例

conda info --envs # 查看环境conda create -n R3.5  # 创建名为R3.5的环境
source activate R3.5  conda list            #查看当前安装的软件
conda install r-base #安装R语言
conda install r-stringi # R包 以 r- 开头 
conda deactivate # 退出当前环境

• 安装指定版本

            conda install numpy=1.11：即安装能模糊匹配到numpy版本为1.11
            conda install numpy==1.11：即精确安装numpy为1.11的版本
  

调取帮助文档

继续调取conda子命令的帮助文档，如
conda create --help
conda install --help

其他

conda list：在当前小环境下，列举所有安装软件。
示例：
source activate rna
conda list
列举rna小环境内安装的所有软件
退出小环境
conda deactivate: linux下conda退出小环境命令
移除小环境
conda env remove --name bio-env：删除小环境及里面的内容