1.一代测序技术
第一代DNA测序技术桑格尔-双脱氧链终止法是最为经典的一代测序技术,人类基因组计划(HGP)主要基于第一代测序技术。HGP完成后,进入后基因组时代,成本高、通量低的传统测序技术不能满足深度测序和重复测序等大规模基因组测序的要求。
2.二代测序技术
Roche公司的454技术、illumina公司的Solexa/Hiseq技术和ABI公司的SOLID技术标志第二代测序技术诞生。其中Roche公司的454测序系统是第二代测序技术中第一个商业化运营的测序平台。其中Illumina市场规模占到75%以上,主打Hiseq。
3.三代测序技术
第三代测序技术以PacBio公司的SMRT和Oxford Nanopore Technologies 的纳米孔单分子测序技术为标志,不需要经过PCR扩增,超长读长,可达二代测序的100倍以上,实现了对每一条DNA分子的单独测序。错误率比二代要高,达到10-15%。
4.全转录组测序流程
(1)样品采集:新鲜样本,避免RNA酶污染
(2)RNA抽提质检:多种检测方法,确保RNA质量
(3)illumina平台测序
(4)生信分析+数据挖掘