2021年,Leader等人通过目前最大的非小细胞肺癌的单细胞测序和CITE-seq,对非小细胞肺癌的微环境进行了多组学的分析,最终构建了一个包括驱动突变、新生抗原、免疫状态等多个元素的肿瘤微环境模式,可以对肿瘤免疫疗法的应答反应进行预判,本文发表在Cancer Cell上。
Graphic abstract.png
本文亮点:
- 单细胞测序揭示了LCAM免疫细胞激活模式;
- CITE测序对转录组分型进行进一步验证;
- 肿瘤免疫激活模式与肿瘤突变负荷,驱动突变,异位抗原相关;
- LCAM预示着对免疫检查点抑制剂较为敏感;
多组学整合分析验证肿瘤间异质性
-
样本间的欧式距离比较,提示肿瘤间的异质性要远高于正常的肺组织间;
Figure 1.png -
DC3是肿瘤微环境中最主要的树突状细胞亚群,cDC1的数量在肿瘤内部会显著地减少;由于mregDC对于调节T细胞的应答功能具有重要的功能,作者采用了多色免疫荧光
Figure 2.png