学习小组DAY3学习笔记-张三

软件管理Miniconda

-1 最好的下载软件

conda介绍

-1如何下载miniconda
百度/谷歌搜索“miniconda 清华”(是清华的conda镜像网站)
登录服务器,进入BIOSOFT目录
自动补全功能,键盘上的那个Tab键,在home目录下,打出cd b,按Tab就可以自动补齐。
cd ~/biosoft
用到wget命令
wget 复制的下载链接,
「for Windows」请记住这里的粘贴不是ctrl+c和ctrl+V了,选中,鼠标左键点一下是复制,右键点一下是粘贴;

怎么安装miniconda

bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
source ~/.bashrc来激活conda
命令行输入conda,出现满屏的信息说明成功了
如果报错,说明你可能没有进行上一步的source ~/.bashrc命令。
开始使用conda

  1. 查看当前服务器上安装的所有软件列表 conda list
  2. 搜索conda软件 conda search fastqc 【这里以数据质控软件fastqc为例】
  3. 安装软件 conda install fastqc -y 【-y是yes,安装过程中conda问你的问题全部回答yes,你可以试试不加-y有什么区别】
  4. 卸载软件 conda remove fastqc -y
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