《R数据可视化手册》学习笔记6---描述数据分布(3)简单密度图

写在前面。

这篇文章对应原书的第6章,主要介绍一些描述数据分布的可视化图形。主要包括如下这些:

  • 直方图
  • 密度图
  • 频数多边形
  • 箱线图
  • 小提琴图
  • Wilkinson点图

密度图

核密度图也是很常用的一种反映数据分布的图形。

简单密度图

使用geom_density语句,映射一个连续型变量

ggplot(data = faithful, aes(x = waiting))  + 
  geom_density()
  • 核密度图是基于样本数据进行总体分布的估计
  • 曲线的光滑程度取决于函数的带宽;带宽越大,曲线越光滑
  • 可以通过adjust进行设置,默认值为1
ggplot(data = faithful, aes(x = waiting))  + 
  geom_line(stat = "density", adjust = 0.25, colour = "orangered")+
  geom_line(stat = "density")+
  geom_line(stat = "density", adjust = 2, colour = "lightblue")

x轴的宽度也是自动分配的,这可能会造成边缘截断,因此可以自己手动设置:

ggplot(data = faithful, aes(x = waiting))  + 
  geom_density(stat = "density", alpha = 0.25, colour = NA, fill = "blue")+
  geom_line(stat = "density") +
  xlim(35,105)

将密度曲线叠加到直方图上,可以对观测值理论分布实际分布进行比较。

注意,密度图的曲线下面积总是1,因此y值较小,因此,使用y=..density..减小直方图的标度

ggplot(data = faithful, aes(x = waiting, y=..density..))  + 
  geom_histogram(fill = "cornsilk", colour = "grey60")+
  geom_density()+
  xlim(35,105)
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