井干式榫卯结构的房屋主要是分布在一些树木比较多的地方 比如东北林区、西南山区尚有个别使用这种结构建造的房屋。
在殷商时期的基葬已见有采用这种井干式结构的木撑，文献记汉代宫苑中有所谓井干楼，可以叠至百层。至于井干式结构的房屋，据云南晋宁石寨山西汉时期演国遗址墓葬出土的青铜鉴建筑模型及图像所示，既可直接建于地上，也可像穿斗式构架一样建于干栏式木架之上。
它有平房和二层楼，平面都是长方形，面阔两间，上覆悬山屋顶。屋顶做法是左右侧壁顶部正中立短柱承脊檩，椽子搭在脊檩和前后檐墙顶的井干木上，房屋进深只有二椽。
井干式结构其特点它耗材量大，建筑面阔和进深受木材长度限制，外观厚重，应用不广泛。在绝对尺度和开设门窗上都受很大限制，因此通用程度不如抬梁式构架和穿斗式构架。
在现在木质房屋建筑过程中运用的不是很多，主要是太费木料了，所以现如今也只有在东北、云南等少数森林覆盖面积比较大的地区以及某些特定的建筑如粮仓上，还保持这种建筑方式，但工艺如今也有很大改进，例如一般现在不会用圆木而是改用长方形截面的方木或者厚木板，结合的榫卯做得会很精致，这样做的好处就是方便运输，就像搭积木一样。
井干式榫卯结构使用的木材多是多孔性材料，使用这样的木材是比较的能保暖在寒冷的冬季可以给人们带来温暖，原木建筑被誉为二十一世纪生态住宅，人类对木材天生就有的自然的亲近感。原木建筑的感觉与水泥、砖块、石材、塑料、金属等所构筑的房屋有本质上的不同。举例来说，你可以感觉很温暖地躺、坐或赤脚脚站在木材上。
相反地在水泥或石材上你会感觉冰冷。在人们对城市的高楼大厦日益厌倦的今天，只有这独特的原木房屋才能带您到达返朴归真的完美境界。自然健康，不但没有化学、放射材料对人体的危害，相反原木散发着沁人心脾的天然香气，木材能够散发出芬达精和负离子，芬达精可以杀死空气中细菌，负离子可以改变睡眠质量，能够调节人体微循环，减低血压，特有益于身心健康。
