R语言学习之 利用devtools从github上下载包

原文来自https://www.jianshu.com/p/2e5c6e52f891

代码如下,直接输入install_github("Package Name","Author Name")

例子1:

install.packages("devtools")

devtools::install_github("immunogenomics/harmony")

library("harmony")

R语言中双冒号的作用 : 要使用某个包里的函数,通常做法是先加载(library)包,再调用函数。最新加载的包的namespace会成为最新的enviroment,某些情况下可能影响函数的结果。而package name::functionname的用法,一是可以在需要用某个函数时临时直接加载包,不用事先library。另一点更重要的是尽可能减少library带来的附带作用,这一点在开发R包时影响较大。而这种写法的副作用,是会稍微慢上那么几毫秒,在需要反复循环使用一个函数时对效率有影响,其他时候除了写起来麻烦一点,基本没有显见的副作用。链接https://www.zhihu.com/question/45929622/answer/140476281

查询此方法的原因:使用如下官网提供代码下载harmony包,频繁报错。换devtools方法后下载成功。

if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))

  install.packages("BiocManager")

BiocManager::install("harmony")

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