linux安装软件
如何 安装软件
conda（相当于app store）
1.安装
1.下载：百度/谷歌搜索“miniconda 清华”（是清华的conda镜像网站）https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/
2. 查看linux版本uname -a
3.找到最新版本的sh（latest），右键-复制下载链接
4.进入biosoft目录（生信软件）
sh是脚本（就是一个程序，后台的代码）文件的后缀，如果安装失败了，这个脚本不需要重新下载的，还可用
5.wget +链接
6.bash +刚刚下载的sh文件
7.激活：source ~/.bashrc
8.添加镜像：
#使用中科大的镜像
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --set show_channel_urls yes
2.应用
查看所有软件：conda list
安装软件（相当于下载app）
conda install fastqc -y【-y是yes，安装过程中conda问你的问题全部回答yes
卸载软件conda remove fastqc -y
3.conda 环境
conda info --envs
用一个文件夹处理RNA-seq时，可以在此路径加上conda环境
建立一个名叫rnaseq的conda环境，然后指定python版本是3，安装软件fastqc、trimmomaticcond： create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y
