直线职能制在大学结构中运用。 学校是以校长为中心的直线领导阶层，校长作为该校重大决策者和组织者，实行主管统一指挥。各学院院长拟订计划、方案以及有关指令，分别从事专业管理，在自己的职责范围内有一定的决定权和对所属下级的权，并对自己院系的工作负全部责任。各学院提议或决策决必须经直线主管批准下达，听从直线部门的直接领导。职能部门参谋只起指导作用，无权直接下达令，各级行政领导人实行逐级负责，实行高度集权。

    在整个结构中指挥系统清晰、统一，高层管理者拥有最高的管理决策权，在遇到重大问题是处理比较有序;责权关系明确。但由于各职能部门按照专业分工来定位，往往容易形成本位主义，从局部利益出发考虑问题，使组织的整体功能难以充分发挥。产生院系之间协调问题的主要原因是沟通障碍。增加各院系之间的沟通联系，建立沟通桥梁。通过有效的沟通使信息交流更加通畅，不仅有助于院系之间的相互提升、互相协调，还能提高行政效率，提升效能。由于组织结构系统刚性大、弹性不足,适应性差,容易因循守旧,对新情况不易及时做出反应。学校在面对变化的环境状态时，无法作出适应的改变。学校在面对变化的环境，需快速进行信息的收集、处理、分析。建立相匹配的信息系统，合理运用信息转变环境。