学习小组Day3笔记--Doctorshann

linux环境下的软件安装

1. miniconda安装和配置

• miniconda安装：清华大学镜像站安装 https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
  

  miniconda安装.png

• minicoda配置

• 激活并添加镜像：Linux中复制粘贴是鼠标左键和右键

  
  
  miniconda镜像添加.png

2. 应用miniconda进行基础操作

• 查看当前所有软件列表 conda list
• 搜索软件 conda search fastqc
• 安装软件 conda install fastqc -y
• 卸载软件 conda remove fastqc -y

3. conda 环境

• 查看当前conda：conda info --envs
• 建立名叫rnaseq的conda环境，指定python版本是3，安装软件fastqc、trimmomatic: conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y
• 删除非空目录--rm -r（有空格）
• 激活新的conda 环境

附上思维导图

day3-linux环境下的软件安装.png

感悟：Linux简介高效，代码横流的感觉很爽。