承接上一篇：采用生物信息学方法筛选和分析白癜风差异表达基因【3】
4．统计分析方法：
应用SPSS21.0软件包进行统计分析。采用两独立样本t检验比较白癜风皮损组织与非皮损组织中DEG mRNA的表达。P < 0.05认为差异有统计学意义。
二、结果
1．白癜风皮损与非皮损皮肤组织间DEG的分析与鉴定：
主成分分析显示，15例白癜风皮损与非皮损组织基本分离，区分度较好，见图1A。R语言软件limma包筛选DEG显示，与非皮损对照组相比，白癜风皮损组共发现148个DEG，其中22个基因表达下调，126个基因表达上调（图1B）。图1C为148个DEG的聚类分析图。其中，角蛋白9（keratin 9，KRT9）、C-X-C趋化因子配体10（C-X-C motif chemokine ligand 10，CXCL10）、核糖体生物起源因子（ribosomal biogenesis factor，C8ORF59）、类胰蛋白酶α/β-1（tryptase alpha/beta-1，TPSAB1）和核糖体蛋白L26（ribosomal protein L26，RPL26）是前5位上调的基因；前黑素体蛋白（premelanosome protein，SILV）、核糖核酸酶P RNA组分H1（ribonuclease P RNA component H1，RPPH1）、酪氨酸酶相关蛋白1（tyrosinase related protein 1，TYRP1）、黑色素A（melan-A，MLANA）和4号染色体开放阅读框48（chromosome 4 open reading frame 48，LOC401115）是前5个下调基因。
图1
15例白癜风患者皮损与非皮损皮肤组织间差异表达基因（DEG）分析 1A：主成分分析图，两组区分度较好；1B：白癜风皮损与非皮损组织间DEG的火山图；1C：DEG的聚类分析热图
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