写在前面
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首先,我们更新过最多的内容还是单细胞教程
单细胞教程全收录
单细胞数据分析系列教程:
B站视频,先看一遍视频再去看推送操作,建议至少看三遍:
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本公众号单细胞相关资料都可以在这里订阅:
单细胞测序基础数据分析保姆级教程,代码部分整理在往期推送之中:
手把手教你做单细胞测序数据分析|5.细胞类型注释,从入门到入土
单细胞图片改造计划:
SCENIC转录因子分析:
SCENIC单细胞转录因子预测|5.step1+step2构建共表达网络与regulon
SCENIC单细胞转录因子预测|6.Step3 利用AUCell对Regulon评分
SCENIC单细胞转录因子预测|7.Step4 二元矩阵的计算与可视化
SCENIC单细胞转录因子预测|8.Step5 regulon聚类、分群、降维
上游fastq文件处理:
单细胞分析的最上游——处理Fastq文件:cellranger
单细胞分析的最上游——处理Fastq文件:dropseqRunner
Cellranger报错:Unable to distinguish between [SC5P-R2, SC3Pv2] ...
细胞通讯
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往期推送
拟时序分析
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往期推送
单细胞测序数据进阶分析—《拟时序分析》5.初识monocle3
单细胞测序数据进阶分析—《拟时序分析》6.monocle3的降维、分群、聚类
单细胞测序数据进阶分析—《拟时序分析》7.monocle3的拟时序分析
单细胞拷贝数变异
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