服务器中安装Rstudio以及Devtools安装

  1. 首先是对R和Rstudio的安装

在linux中安装R以及Rstudio

R安装:


#查看 ubuntu 系统信息

user@super-server:~$ lsb_release -a

No LSB modules are available.

Distributor ID: Ubuntu

Description:    Ubuntu 18.04.1 LTS

Release:    18.04

Codename:  bionic

#获取 root 权限,因为只有root可以修改sources.list文件

user@super-server:~$ sudo -s

#查看源信息

root@super-server:$ cd /etc/apt/

root@super-server:~$ vim /etc/apt/sources.list

#在末尾添加相应版本的源信息

deb https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu bionic-cran35/ #我的系统是bionic

#or 选择自己喜欢的源

deb https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN//bin/linux/ubuntu bionic-cran35/

root@super-server:/etc/apt# su user

#更新源列表

user@super-server:~/etc/apt$  sudo apt-get update

...

由于没有公钥,无法验证下列签名: NO_PUBKEY 51716619E084DAB9

...

# 解决报错

user@super-server:/etc/apt$ sudo apt-key adv --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-keys 51716619E084DAB9

Executing: /tmp/apt-key-gpghome.sA6IGCcJzS/gpg.1.sh --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-keys 51716619E084DAB9

gpg: 密钥 51716619E084DAB9:公钥“Michael Rutter <marutter@gmail.com>”已导入

gpg: 合计被处理的数量:1

gpg:              已导入:1

user@super-server:/etc/apt$ sudo apt-get update

获取:1 https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN//bin/linux/ubuntu bionic-cran35/ InRelease [3,609 B]

获取:2 https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN//bin/linux/ubuntu bionic-cran35/ Packages [41.6 kB]           

获取:3 https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu bionic-cran35/ InRelease [3,609 B]                         

命中:4 http://security.ubuntu.com/ubuntu bionic-security InRelease                           

获取:5 https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu bionic-cran35/ Packages [41.6 kB]

命中:6 http://cn.archive.ubuntu.com/ubuntu bionic InRelease                 

命中:7 http://cn.archive.ubuntu.com/ubuntu bionic-updates InRelease   

命中:8 http://cn.archive.ubuntu.com/ubuntu bionic-backports InRelease

已下载 86.8 kB,耗时 2秒 (46.7 kB/s)

正在读取软件包列表... 完成

#安装 r-base,sudo默认最新版3.5.3

user@super-server:~$  sudo apt-get install r-base

# 查看R版本

user@super-server:~$  R

R version 3.5.3 (2019-03-11) -- "Great Truth"

Copyright (C) 2019 The R Foundation for Statistical Computing

Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)

Rstudio 安装:


#安装:

user@super-server:~$ sudo apt-get install gdebi-core

user@super-server:~$ wget https://download2.rstudio.org/rstudio-server-1.1.463-amd64.deb

user@super-server:~$ sudo gdebi rstudio-server-1.1.463-amd64.deb

user@super-server:~$ ifconfig # 查看服务端ip地址

#检查运行:

user@super-server:~$ sudo rstudio-server verify-installation #检查是否安装正确

user@super-server:~$ sudo  rstudio-server start #启动

user@super-server:~$ sudo  rstudio-server status #查看状态

user@super-server:~$ sudo  rstudio-server stop #停止

user@super-server:~$ ifconfig |grep 'inet addr' #查看服务器ip

user@super-server:~$ sudo  rstudio-server start #修改配置文件后重启

user@super-server:~$ sudo  rstudio-server active-sessions #列出活跃的sessions

user@super-server:~$  sudo  rstudio-server suspend-session <pid> #暂停sessions

user@super-server:~$  sudo  rstudio-server suspend-all #暂停所有session

#配置文件目录:

/var/log/rstydio-server/ #Rstudio日志目录

#配置文件:

/etc/rstudio/rserver.conf

使用:本地浏览器打开:

http://192.168.1.103:8787。账户密码为安装时的账户密码。

以及在R中安装devtools安装工具:

在安装devtools包前先执行如下命令:


sudo apt-get install gfortran

sudo apt-get install build-essential

sudo apt-get install libxt-dev

sudo apt-get install libcurl4-openssl-dev

sudo apt-get install libxml++2.6-dev

sudo apt-get install libssl-dev

然后才在R中进行安装devtools包和sparkR包


install.packages("devtools", dependencies = T)

library(devtools)

install_github("amplab-extras/SparkR-pkg", subdir="pkg")

参考文章:https://www.jianshu.com/p/51cb217ff4cc

参考文章:https://blog.csdn.net/qq_27755195/article/details/53609787

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