软件/目录/方法汇总篇：
TDEseq：高效灵活的非参数方法，用于检测多个时间点上的基因表达模式；时间序列scRNA-seq数据的时间差异表达基因
SciBet：NC：SciBet as a portable and fast single cell type identifier；不好用，号称快，但是数据格式要求行为细胞列为基因，数据格式是TPM，文章没去看，猜测用于bulk的；此外，似乎不支持seurat—obj，没有meta信息等等
singleR：细胞自动注释，免疫细胞较友好；
XGBoost: A Scalable Tree Boosting System：1) 针对稀疏数据的“稀疏感知”并行建树算法；2) 适用于带权样本的加权分位数（quantile）草图，用于近似分裂候选；3) 基于缓存友好、数据压缩与磁盘分片的端到端系统设计，实现单机与分布式环境下对十亿级样本的高效训练。
Drug2cell：这是一个用于在 scanpy 中评估基因组活动的实用功能集合，适用于每个细胞评分和基于标记的富集/过度表现分析。Drug2cell 利用已建立的方法，并以方便/高效的形式提供，以便于 scanpy 使用。该包附带一组 ChEMBL 派生的药物靶点集，但具有简单的输入格式，因此可以轻松与任何所选的基因组一起使用。 2023年的nature Spatially resolved multiomics of human cardiac niches
