发简信
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全外显子组测序分析 - 流程2一、基础背景 根据研究对象和目的的不同，选择后续进行胚系突变还是体细突变的分析。 定义： 胚系突变是发生在生殖细胞（精子和卵子）中，由父亲的精子...
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全外显子组测序分析 - 流程1
使用一个数据样本（EXON_FYY_1.fastq.gz，EXON_FYY_2.fastq.gz）作为示例，样本多可以写成循环。 Step 0：...
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全外显子组测序分析 - 背景一、全外显子组 vs 全基因组概念 1. 测序范围 全外显子测序（WES） 仅针对基因组中外显子区域（约占全基因组的1-2%），即能够编码蛋白质...
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GEO下载的SRA文件只得到1个fastq将SRA文件转成fastq文件可以用fasterq-dump或者parallel-fastq-dump，其中parallel-fastq-dum...
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Drug2Cell 安装及使用教程简介 Drug2Cell 是用于scanpy中基因组活性评估的效用函数的集合，既用于每个细胞评分，也用于基于标记的富集/过表示分析。Drug2c...
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单细胞测序技术scRNA-seq及其在动物学上的应用《动物学科学研讨》课程老师让介绍一种测序技术，及其在动物学上的应用的，PPT共享！ （每帖分享：时间应该被用在有价值且让你快乐的地方，而不是无意...
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FeaturePlot画图让有表达的点展示在上方在使用FeaturePlot画图的时候会因为细胞太多存在一些细胞被覆盖的现象，导致表达某基因的细胞由于处于底层而展示不出来。我们如果想要让表达特...
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利用cellranger构建病毒基因组并整合到人中定量分析1.软件和参考基因组文件下载 cellranger下载 建议下载比较新的的，我这个是因为想和原文保持一致所以才下载的老版本官网下载：https:...
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R构建seurat和scanpy 重复基因处理方式不同在处理病毒数据的时候遇到一个问题，由于有不同病毒对应的 蛋白编码基因相同，导致读取的时候出现问题：主要是在R中"ORF1ab"读取为0但是sca...