在纪录片《宇宙的运行》中，科学家通过超新星的爆炸来解释宇宙产生及运行的原理，其中各种元素的刹那产生、扩散、聚合、分解，形成了星辰和生命的永不停歇的生生灭灭。其过程历经无始劫（地球一生灭为一劫)，以至无终极。科学家说爆炸产生的伽马射线，一经照射足以毁灭太阳系，然而光波也好，声波也好，热量也好，其摧枯拉朽的威力却仅占其总能量的1/100。
科学家不断地在计算机里模拟爆炸和演算，发现另外99/100的能量正以中微子的形式无处不在地传播――就在此时，从地球的另一端穿地球而过，穿墙，穿家具，穿我们的身体而过。也正是这些元素在不同的条件下聚合衍生出细胞、微生物，以致我们和一切。
纪录片中，英国女科学家举起手臂说：你们看我们的手、皮肤、肌肉、血液，都是元素的聚合，都是中微子的化合产物。
然而更匪夷所思的是，科学家说：宇宙的爆炸源自于一个原点，一个仅有头发丝切面1000000亿亿亿分之一的原点。然后衍化出宇宙星辰万物。
这令人不禁疑问：生命是什么？生命中的意识又是什么？在苍茫的星空，是否还有更多由元素、波动衍化的无穷际的光怪陆离的事物？
也联想到当年，释迦牟尼世尊在菩提树下禅定七天后，开眼望星空的感叹：“奇哉，奇哉！一切众生皆具如来智慧德相，只因妄想执著而不能证得”。或许他当时透视到的正是科学不断进步才一点点接近的真相，生命本源、意识流转的那一灵光。“色身、及至山河虚空大地，都是这一妙明真心中物”（世尊语）。万相生灭都是这一真心的演绎与幻化，都在本我的真心中。
世尊悟到这个大秘密后，要回归宇宙本体。当时帝释天人下来跪求他不要涅槃，恳请留下来讲经说法。世尊说：“止，止！我法妙难思！”。是啊，若不是借助现代科学，宇宙实相是不可能阐述的。但世尊还是留下广说“缘起、性空和觉察之道”的大法，讲物物相因，境随心转，讲如何离苦得乐。
不过，说法只是种方便，不能真正说明体证般若智慧的实相，所以历来人们苦行、断臂、面壁、辟谷、参禅，只为证得“我有明珠一颗，久被尘劳关锁，今朝尘尽光生，照破山河万朵”的通达无碍、妙明自在的实相。这个明珠，也就是王阳明说的“万古团圆一轮月”，是本我，也叫真心，也即智慧。当他通达的时候，就见山非山，见水非水。明白后又见山是山，见水是水了。
