利用Tbtools提取Fasta序列

1.打开软件--Fasttools----》Fast Extract(recommended)

image.png

2. 建立基因组索引

image.png

3. 设置输出数据路径

4.设置输入数据,\t f分开。

示例:MSU

image.png

image.png

LOC_Os10g33000
ATGGTGGAAGAAAGAGAAAGCTTCGAGAGTCAGTGGGCGCCCTCCGATGTGACAGAAGAT
AATCTGAAGGAGATGGTGGCGCACGGCGTTCTTCCAGCGAAGGAGATCATCGGGTGGCGA
CCGGCATTTGGCGAAGCATTCCCGACTCCCGATACGCATGAAATCGTGGTATTTGCTCAC
TTCTTCTATGGCGGATTTTCTCTTCCAACCTCAAGATTTTTCCGGGGCATTCTGAACTTC
TACGGGATTAGCTTGCATCATCTGAATCCAAACTCCATAGTGCATATTGCCAATTTTATC
CACGCCTGCGAAGCTTTTCTGGGCATTAGGCCTCATTTTGCCTTGTTCCGCCGCATCTTC

提取的数据:

Chr10 17276945 17279876
ATGGTGGAAGAAAGAGAAAGCTTCGAGAGTCAGTGGGCGCCCTCCGATGTGACAGAAGAT
AATCTGAAGGAGATGGTGGCGCACGGCGTTCTTCCAGCGAAGGAGATCATCGGGTGGCGA
CCGGCATTTGGCGAAGCATTCCCGACTCCCGATACGCATGAAATCGTGGTATTTGCTCAC
TTCTTCTATGGCGGATTTTCTCTTCCAACCTCAAGATTTTTCCGGGGCATTCTGAACTTC
TACGGGATTAGCTTGCATCATCTGAATCCAAACTCCATAGTGCATATTGCCAATTTTATC
CACGCCTGCGAAGCTTTTCTGGGCATTAGGCCTCATTTTGCCTTGTTCCGCCGCATCTTC

©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
【社区内容提示】社区部分内容疑似由AI辅助生成,浏览时请结合常识与多方信息审慎甄别。
平台声明:文章内容(如有图片或视频亦包括在内)由作者上传并发布,文章内容仅代表作者本人观点,简书系信息发布平台,仅提供信息存储服务。

相关阅读更多精彩内容

友情链接更多精彩内容