【RSE期刊】 基于光谱数据的多任务植物功能性状预测模型

2023年7月,德国学者Eya Cherif等在Remote Sensing of Environment期刊上发表了题为“From spectra to plant functional traits: Transferable multi-trait models from heterogeneous and sparse data”的文章,提出了将高光谱数据转化为适用多种植物类型、多种传感器数据类型的广义方法,并提出了一种基于卷积网络的多任务模型。

关键词:高光谱遥感、植物表型、深度学习、光谱成像、冠层特性、弱监督学习、多任务回归

试验模型

多性状CNN模型、单性状CNN模型、单性状PLSR模型

图1:多性状和单性状模型的模型性能评估

该研究利用42个数据集中冠层反射率数据和性状测量数据,比较了多性状CNN模型与单性状CNN模型和单性状PLSR模型的预测性能。基于合并数据集的Spearman系数的相关性分析表明,几个性状之间存在高度相关性。叶面积指数与叶片成分相关性较弱,环境氮、碳含量与叶片含氮量呈正相关,叶片水分含水量与叶片其它成分也呈正相关。

图2:基于Spearman等级相关系数的性状相关图

通过5折交叉验证得出的模型性能表明,不同性状的总体预测性能差异很大。CNN的模型预测性状准确度基本超过PLSR模型(R²: 0.18~0.66, nRMSE: 11~22%),PLSR模型在一些性状上表现出较大偏差。

图3.试验模型预测20个植物性状的精度比较

与单性状CNN模型相比,多性状CNN模型对色素、常量元素、木质素、纤维素、大量元素的分析效率更高。即使是仅在几个数据集中出现的性状(如硫、铜、硼、镁),多性状CNN也比单性状CNN模型表现得更好。

图4: 试验模型分析预测20个植物性状的相对重要性

高光谱遥感正在成为未来全球监测应用的重要工具,结果表明,所有测试的CNN模型表现都优于PLSR模型,多性状CNN模型比单性状CNN模型表现更好。

图5:从光谱到植物功能性状:来自异质稀疏数据的可迁移多性状模型



此研究结合了冠层高光谱反射率和植物性状的异质数据集,结果表明多性状CNN模型分析效率最高,强调了弱监督方法的潜力,并在创建针对多种生理、生化性状的有效预测模型方面迈出了重要的一步。

原文链接:doi : 10.1016/j.rse.2023.113580

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