在下載GEO數據時遇到的各種問題

在這里記錄一下由于我的愚蠢而在下載GEO時遇到的各種問題

1  controlled access

230926 GSE100351 去了EGA里申請帳號，然而沒有下文，一直沒有給我回郵件。。。


GSE100351

2 細胞系不能用啦！（除非有很多個不同的細胞系）

231008 GSE169590 雖然TRAC-Seq的切割分數能代表甲基化水平，但是只有ESCC細胞系的數據。在下載之前要看清楚Overall design。。。


GSE169590

3 只有矩陣 沒有原始數據

231018  GSE65205 想要下載RNA-seq的原始數據以作其他分析 但找不到sra


sra呢???
只提供了矩陣 沒有sra
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