生信学习小组-Day5 - 三三

关键词

R语言,数据类型,向量,数据框

今日笔记


<一> 向量
来自生信星球
1. 赋值命令
  • x<- num1:num2
  • x<- seq(num1,num2,by=a)
  • x<- rep(num1:num2,times=a)
应用举例
2. 从向量中提取元素

(1)根据元素位置

(2)根据值


<二> 数据框
1. 读取本地数据
  • read.csv()
read.csv()
  • read.table()
read.table()
2. 设置行名和列名
  • colnames() # 查看列名
  • rownames() # 查看行名
3. 数据框的导出
  • write.table(frame,file = "bjyx.txt",sep = ",",quote = F) #分隔符改为逗号,字符串不加双引号(默认格式带有双引号)
4. 变量的保存与重新加载(格式为RData)
  • save.image(file="bjyx.RData") # 保存当前所有变量
  • save(frame1,file="frame1.RData") # 保存其中一个变量
保存文件名为"bjyx.RData"
  • load("frame1.RData") # 加载命令
加载"bjyx.RData"
5. 提取元素
  • x[a,b] # 提取第a行第b列
  • x[a,] # 提取第a行
  • x[,b]x[b] # 提取第b列(两种命令格式有差异)
  • x[a:b] # 第a列到第b列
  • x[c(a,b)] # 第a列和第b列
  • x$b # 提取b列
应用举例
6. 直接使用数据框中的变量

(1)提取某两列作散点图(不够高效

a <-data.frame(case=paste("S",c(1:50)),values=runif(50))
plot(a$case,a$values)

(1)

(2)attach

attach(a)
plot(case,values)

(2)

(3)with

with(a,{
plot(case,values)
x<<-summary(values)
})
x # 运行完后打印 x

(3)

Tips

  • ?+命令 可查看帮助
  • 命令未输完(括号啥的没补全)时回车才可以换行...
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