目前，人们用于治疗由病毒感染引起的疾病有几种方法，即疫苗，抗病毒药物，联合治疗，以及间歇HAART加疫苗，有望完全治愈HIV。
疫苗
1.制作疫苗的几种方法
灭活病毒、通过基因工程制作病毒亚单位（病毒蛋白）。
载体疫苗（运用非致病细菌或病毒运载HIV病毒基因到机体）。
减毒疫苗（先把病毒培养在“错误”的宿主细胞中，减弱毒力，再进行接种）。
DNA疫苗（将DNA片段注入小鼠体内，仍在进行动物实验）。
2.疫苗试验：三期I II III。不同阶段临床试验有不同关注焦点，观察疫苗是否具有安全性、确定使用剂量、有效性、副作用等。疫苗也可在病毒感染后接种，在病毒繁殖前激活免疫系统。
3.缺点：病毒高变异率，抗原漂移和抗原转变，以及接种后难以达到较高的安全性。
抗病毒药物
1.广谱抗病毒药物：无
2.目前抗病毒药物：AZT，阿昔洛韦，病毒唑，foscarnet，nevirapine，HIV-1蛋白酶抑制剂，Relenza/Tamiflu神经氨酸酶抑制剂。
3.抗病毒药物检测：检测某种化合物潜在的抗病毒活性。
4.抗病毒药物作用靶点：对病毒穿入、脱壳、基因组复制、装配、释放过程产生阻碍。
5.缺点：对宿主细胞也有伤害，产生副作用。
联合治疗：作用不同靶点的抗病毒药物同时用于治疗。
-病毒突变只发生在复制阶段。
-高活性抗逆转录病毒疗法：HAART/鸡尾酒疗法即三种不同作用的抗病毒药物同时用于治疗。
-缺点：无法治愈疾病，非复制环节病毒不受影响，且一旦停止HAART会引起病毒“反弹”，停药容易引起耐药性，若患者放松警惕，有不良生活方式，会延长个体传染时期。
-其他办法：间歇HAART+疫苗
