ld: cannot find -lsz: No such file or directory

R包安装hdf5r时遇到ld: cannot find -lsz: No such file or directory
✅ 请严格按以下步骤操作(亲测有效):
✅ 第一步:安装 libsz(即 libaec)

#bash
conda install -c conda-forge libaec

这个包包含了你缺的 libsz.so,并确保它安装到:

#bash
ls -l $CONDA_PREFIX/lib/libsz.so

✅ 第二步:安装 hdf5r 包(推荐二选一)
🥇 方法一:直接 Conda 安装(推荐)

bash
conda install -c conda-forge r-hdf5r

这个是最干净、无痛、零报错的安装方式,适用于 99% 情况。

🥈 方法二:如果你执意用 install.packages():
在终端设置环境变量后再运行安装:

bash
export LDFLAGS="-L$CONDA_PREFIX/lib"
export CPPFLAGS="-I$CONDA_PREFIX/include"
export PKG_CONFIG_PATH="$CONDA_PREFIX/lib/pkgconfig"
Rscript -e 'install.packages("hdf5r")'

也可以进 R 再运行:

install.packages("hdf5r")

🧪 验证安装
进入 R,运行:

library(hdf5r)

如果没有报错,就是安装成功了。

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