发简信
IP属地：北京
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互帮互助问答帖
虽然没有几个关注，但能看到这些笔记的应该都是同志们 有时候朋友的私信我可能看不到，我也不一定能解决。 群体遗传学方面、生信方面、R语言等等，如果...
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CLUES 推断位点的受选择时间
CLUES（Conditional Likelihood Under Evolutionary Scenarios）是一个用于推断单个位点在群体...
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Relate 估计位点的起源时间1、转换文件格式 从 VCF 文件转换为 relate 软件可以读取的 hap 格式： PATH_TO_RELATE/bin/RelateFil...
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VCF 文件格式转换
推荐一个 VCF 文件格式转换的脚本。 https://github.com/edgardomortiz/vcf2phylip 常见用法：将 V...
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LDBlockShow 计算连锁不平衡（LD）热图
安装： wget https://github.com/hewm2008/LDBlockShow/archive/v1.40.tar.gztar...
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基于两个 fasta 序列获得 vcf 文件
1. 基于 BWA 进行序列比对 bwa index reference.fastabwa mem reference.fasta sample...
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BAYENV2 计算位点的 XTX 值
Bayenv 是一种基于环境相关性识别与局部适应相关位点的软件，主要用于检测那些在局部适应过程中可能发挥重要作用的遗传标记（如 SNP）。 和环...
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PGDSpider 进行格式转换下载安装： wget https://software.bioinformatics.unibe.ch/pgdspider/PGDSpider_...
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tar 打包和压缩文件
tar是 Linux/Unix 中的一个常用工具，用于创建和提取归档文件。tar的全称是 “tape archive”，它原本设计用于将文件存储...