Adam中SUPP数据集的应用

SUPP数据集是对变量的补充说明,我们先直接来看一下一个项目中 ADCM 中变量 ATC1 的生成。Spec中的逻辑是:

SUPPCM.QVAL where QNAM= ARATC1T for the given USUBJID and CMSEQ if CMCAT = "ART MEDICATIONS";
SUPPCM.QVAL where QNAM= CMATC1T for the given USUBJID and CMSEQ if CMCAT = "PRIOR AND CONCOMITANT MEDICATIONS";

这个变量的有两个来源,我们拿一个来举例。ATC1 的值为 SUPPCM 数据集中的 QVAL,QVAL有那么多条记录,有什么条件呢?

  1. SUPPCM.QNAM= ARATC1T
  2. USUBJID 相同
  3. CMSEQ 相同
  4. CM.CMCAT = "ART MEDICATIONS"

我看到这些条件第一个想法是,CM 与 SUPPCM 按照USUBJID、CMSEQ拼接就好,然后根据另外两个条件进行赋值就好了。可当我看到SUPPCM数据集的结构时,突然有种无从下手的感觉。
SUPPCM截图

首先SUPPCM数据集中没有CMSEQ这个变量,所以上面第一个想法无法直接运行。思考了一会,第一个想法是用Proc SQL进行拼接。与DATA相比,SQL拼接的灵活性要好很多,可以输出多个条件对拼接进行约束。
SQL拼接
上面的代码思路是,单独新建一个新的数据集用来生成 ATC1。这过程不需要将两数据集中的拼接变量修改成相同的名称,可以直接引用进行比较:
on a.usubjid =b.usubjid and a.cmseq = b.idvarval_n

同时,在Where语句中进行条件设置,不需要多余的处理。生成的数据集如下:
ATC1

那不用SQL语句,DATA步是否可以实现这样的效果呢?也是可以的。前面无从下手的原因是,在SUPPCM数据集中,用于拼接的BY变量不直接存在,得新建后在进行拼接。CMSEQ不是一个单独的变量,它是一个标志符(IDVAR变量的值),具体的CMSEQ值在IDVARVAL中,无法直接拼接。这种情况可以先进行条件选择,使得IDVARVAL变量保存的都是CMSEQ的值,这样以这个变量作为BY变量就可以拼接了;同理,QNAM的约束条件也提前处理好,新建CMTRT变量与CM数据集中的CMTRT值进行对应。我们可以先看下代码:
Data步拼接
由于DATA步拼接要保证BY变量的名称相同,所以要提前重命名或生成需要的BY变量;而PROC SQL中不需要保证BY变量名称相同,与DATA步相比,显得简洁。

回过头来看之前的代码,可以进行一些小修改。在SQL拼接中,目前的思路是需要哪些变量,就生成新的数据集,数据集里包含ID类的变量,用于后来的拼接,思路很流畅;当然,也可以一步到位,直接将新变量拼接到CM数据集中,新建一个拼接一个,不需要最后的汇总拼接。

在DATA步拼接中,可以不进行观测数筛选,保留其他不符合条件的观测,因为在拼接过程中这些观测不影响拼接结果,如下图:
DATA步拼接小修改

这样的修改因为保留了很多观测,拼接的效率会降低,但是整个思路会更容易理解。

最后编辑于
©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
  • 序言:七十年代末,一起剥皮案震惊了整个滨河市,随后出现的几起案子,更是在滨河造成了极大的恐慌,老刑警刘岩,带你破解...
    沈念sama阅读 216,193评论 6 498
  • 序言:滨河连续发生了三起死亡事件,死亡现场离奇诡异,居然都是意外死亡,警方通过查阅死者的电脑和手机,发现死者居然都...
    沈念sama阅读 92,306评论 3 392
  • 文/潘晓璐 我一进店门,熙熙楼的掌柜王于贵愁眉苦脸地迎上来,“玉大人,你说我怎么就摊上这事。” “怎么了?”我有些...
    开封第一讲书人阅读 162,130评论 0 353
  • 文/不坏的土叔 我叫张陵,是天一观的道长。 经常有香客问我,道长,这世上最难降的妖魔是什么? 我笑而不...
    开封第一讲书人阅读 58,110评论 1 292
  • 正文 为了忘掉前任,我火速办了婚礼,结果婚礼上,老公的妹妹穿的比我还像新娘。我一直安慰自己,他们只是感情好,可当我...
    茶点故事阅读 67,118评论 6 388
  • 文/花漫 我一把揭开白布。 她就那样静静地躺着,像睡着了一般。 火红的嫁衣衬着肌肤如雪。 梳的纹丝不乱的头发上,一...
    开封第一讲书人阅读 51,085评论 1 295
  • 那天,我揣着相机与录音,去河边找鬼。 笑死,一个胖子当着我的面吹牛,可吹牛的内容都是我干的。 我是一名探鬼主播,决...
    沈念sama阅读 40,007评论 3 417
  • 文/苍兰香墨 我猛地睁开眼,长吁一口气:“原来是场噩梦啊……” “哼!你这毒妇竟也来了?” 一声冷哼从身侧响起,我...
    开封第一讲书人阅读 38,844评论 0 273
  • 序言:老挝万荣一对情侣失踪,失踪者是张志新(化名)和其女友刘颖,没想到半个月后,有当地人在树林里发现了一具尸体,经...
    沈念sama阅读 45,283评论 1 310
  • 正文 独居荒郊野岭守林人离奇死亡,尸身上长有42处带血的脓包…… 初始之章·张勋 以下内容为张勋视角 年9月15日...
    茶点故事阅读 37,508评论 2 332
  • 正文 我和宋清朗相恋三年,在试婚纱的时候发现自己被绿了。 大学时的朋友给我发了我未婚夫和他白月光在一起吃饭的照片。...
    茶点故事阅读 39,667评论 1 348
  • 序言:一个原本活蹦乱跳的男人离奇死亡,死状恐怖,灵堂内的尸体忽然破棺而出,到底是诈尸还是另有隐情,我是刑警宁泽,带...
    沈念sama阅读 35,395评论 5 343
  • 正文 年R本政府宣布,位于F岛的核电站,受9级特大地震影响,放射性物质发生泄漏。R本人自食恶果不足惜,却给世界环境...
    茶点故事阅读 40,985评论 3 325
  • 文/蒙蒙 一、第九天 我趴在偏房一处隐蔽的房顶上张望。 院中可真热闹,春花似锦、人声如沸。这庄子的主人今日做“春日...
    开封第一讲书人阅读 31,630评论 0 21
  • 文/苍兰香墨 我抬头看了看天上的太阳。三九已至,却和暖如春,着一层夹袄步出监牢的瞬间,已是汗流浃背。 一阵脚步声响...
    开封第一讲书人阅读 32,797评论 1 268
  • 我被黑心中介骗来泰国打工, 没想到刚下飞机就差点儿被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留,地道东北人。 一个月前我还...
    沈念sama阅读 47,653评论 2 368
  • 正文 我出身青楼,却偏偏与公主长得像,于是被迫代替她去往敌国和亲。 传闻我的和亲对象是个残疾皇子,可洞房花烛夜当晚...
    茶点故事阅读 44,553评论 2 352