1 GPS-Uber：一个用于预测一般和e3特异性赖氨酸泛素化位点的混合学习框架

文章链接：https://academic.oup.com/bib/advance-article-abstract/doi/10.1093/bib/bbab574/6509047

DOI：10.1093/bib/bbab574/6509047

期刊：BiB

发布时间：2022 年 1 月 17 日

初始基准数据集、二次训练数据集和独立测试数据集均可在：http://gpsuber.biocuckoo.cn/userguide.php上免费下载。

CSDN上的文献解读：https://blog.csdn.net/weixin_45156147/article/details/123329775?spm=1001.2101.3001.6650.5&utm_medium=distribute.pc_relevant.none-task-blog-2%7Edefault%7EBlogCommendFromBaidu%7ERate-5.pc_relevant_antiscanv2&depth_1-utm_source=distribute.pc_relevant.none-task-blog-2%7Edefault%7EBlogCommendFromBaidu%7ERate-5.pc_relevant_antiscanv2&utm_relevant_index=6

在线预测网址：http://gpsuber.biocuckoo.cn/index.php

可以预测特定E3对特定底物的泛素化位点

2 UbiNet2.0

网址：https://awi.cuhk.edu.cn/~ubinet/index.php

2021年发布

一个包含两千多对人类E3和底物互作关系的数据库，有实验验证，比较全，同时也可以下载PPI数据

还从各个数据库收录了100多万对人类的蛋白质互作信息

3 PLMD赖氨酸修饰数据库

http://plmd.biocuckoo.org/

似乎也是GPS系列的

内有很多修饰，应该是可以用作修饰机器学习的数据集。每个基因都标注了修饰位点。

先写这么多