ssAAV（单链腺相关病毒）和 scAAV（自互补腺相关病毒）有以下区别：
基因组结构
ssAAV：基因组为单链 DNA，由两个野生型 ITR 序列及中间的目的基因序列等构成。
scAAV：基因组由单链 DNA 经过特殊改造而成，其中一个 ITR 发生缺失或突变，导致其能形成自我互补的双链结构。
包装容量
ssAAV：可包装相对较大的基因片段，一般能容纳约 4.7kb 的单链 DNA。
scAAV：包装容量只有 ssAAV 的一半左右，通常约为 2.3kb。
基因表达过程
ssAAV：进入细胞核脱衣壳后，需要借助宿主 DNA 聚合酶以自身为模板合成第二条链，或者通过分子间退火形成双链 DNA，才能启动基因转录。
scAAV：入核后，其自我互补的基因组可直接折叠形成具有转录活性的双链 DNA，无需等待宿主细胞合成第二条链，能快速启动基因转录。
基因表达效率和速度
ssAAV：因需要先进行双链转化，在达到相同表达水平时往往需要更多的病毒颗粒和较长时间。
scAAV：无需经历双链合成步骤，能实现外源基因的快速、高水平表达。
生产成本和产量
ssAAV：生产工艺相对简单，生产成本相对较低，在大规模生产中产量通常较高。
scAAV：由于其特殊的基因组结构和生产要求，生产难度相对较大，生产成本可能较高，产量相对较低。
