阴差阳错竟然安上了
直接安装seurat报错
ERROR: compilation failed for package ‘RcppTOML’
* removing ‘/GPUFS/scut_hlchen_5/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/RcppTOML’
Warning in install.packages : installation of package ‘RcppTOML’ had non-zero exit status
方式 参考 https://www.softwarecollections.org/en/scls/rhscl/devtoolset-8/
在R终端输入
yum install centos-release-scl
yum install devtoolset-7-gcc*
scl enable devtoolset-7 bash
然后进入R环境:输入大写R
安装devtools
install.packages("devtools")
可能提示随便选一个镜像,安装成功了
回到R界面后发现可以调用devtools安装别的包了
装上RcppTOML
require(devtools)
install_version("RcppTOML", version = "0.1.3", repos = "http://cran.us.r-project.org")
然后就可以直接用BiocManager::install("Seurat")装上"Seurat"了!!