前天的作业用偷懒的方法完成后,很惭愧,虽然后来也找到了转换ID的代码,但是确实没有太多的编程思维,还是需要训练。
上次拿到的是人的gene symbol,转换成"ENTREZID"的gene ID,而且如果丢失太多的情况下需要先转换成ENSEMBL再转。
所以今天来总结一下,争取记住一个包:
参考学习资料:
- http://www.bioconductor.org/packages/release/data/annotation/html/org.Hs.eg.db.html
- http://www.bioconductor.org/packages/release/BiocViews.html#___Organism
- http://www.biotrainee.com/thread-2771-1-1.html
org.Hs.eg.db
Genome wide annotation for Human
上面第一个链接点进去即可看到全部介绍。
第二个链接是所有物种的数据包在bioconductor的集合
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第三个链接则是之前在技能书有前辈总结的。