Arashare 拟南芥突变体购买步骤
1. Arashare 网址:AraShare科学--服务条款
订购流程:AraShare科学--使用指南
2. 按照使用指南搜索需要的突变体。
3. 如何确定突变体的插入位点及方向,见使用指南第7条,以SALK 为例:
SALK 网址-引物设计:T-DNA Primer Design
SALK网址-T-DNA Express: Arabidopsis Gene Mapping Tool
3.网页打开后如上图所示。红框为基因,箭头代表方向;蓝框为SALK编号,其箭头的位置即大致在基因中的位置,方向为插入方向,可点击,点击后会出详细信息;紫框为search,将在arashare的SALK编号输入,对应的Type为T-DNA; 或者输入基因直接点击。
4.点击编号后,如图。点击紫框中的Seq,即测序的insertion flank sequence, 通过将seq比对对应基因的基因组序列,再结合上述的图示,即可知道T-DNA插入的位置和方向。
根据上述引物设计网址,可设计引物。
SALK T-DNA序列为pROK2载体上的,可在网址中找到。
5. Tair网址
点击Germplasm,输入SALK 编号;或者点击Gene,输入基因座位号
6.基因座位号中的突变体进入后往下拉即可看见。
7.点击紫框所示链接。
8.框为我们需要的信息。Over!